효소 문서 원본 보기

{{위키데이터 속성 추적}}
[[파일:Glucosidase enzyme.png|섬네일|오른쪽|260픽셀|[[말테이스]]는 [[말토스]](엿당)를 [[글루코스]](포도당) 2분자로 전환시킨다. [[활성 부위]]는 빨간색, 기질인 말토스는 검은색, [[보조 인자]]인 [[NAD+|NAD<sup>+</sup>]]는 노란색으로 표시되어 있다. ({{PDB|1OBB}})|alt=Ribbon diagram of glycosidase with an arrow showing the cleavage of the maltose sugar substrate into two glucose products.]]
{{생화학 사이드바}}
'''효소'''(酵素, {{llang|en|enzyme}})는 [[반응물|기질]]과 결합해서 효소-기질 복합체를 형성하여 [[화학 반응]]의 [[활성화 에너지]]를 낮춤으로써 [[물질대사]]의 속도를 증가시키는 생체 [[촉매]]이다. 그리고 경우에 따라 속도를 조절하는 생체 보호기능을 수행하기도 한다.<ref>Biochemistry Chapter10 Regulatory Strategies: Enzymes and Hemoglobin P403L1, Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer - 5E W.H.FREEMAN&COMPANY</ref> 효소는 [[반응물|기질]]을 [[생성물]]로 알려진 다른 분자로 전환시킨다. [[세포]]의 거의 모든 [[물질대사|대사 과정]]은 생명을 유지할 수 있을 만큼의 빠른 속도로 일어나야 하기 때문에 [[효소 촉매작용]]을 필요로 한다.<ref name = "Stryer_2002">{{서적 인용|vauthors=Stryer L, Berg JM, Tymoczko JL | title = Biochemistry | publisher = W.H. Freeman | location = San Francisco | year = 2002 | edition = 5th | isbn = 0-7167-4955-6 | url = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21154/}}{{Open access}}</ref> [[대사 경로]]는 효소에 의존하여 개별 단계들을 촉매한다. 효소에 대해 연구하는 학문을 효소학이라고 하며, 최근에 유사효소(pseudoenzyme) 분석의 새로운 분야가 성장하여 [[진화]] 과정에서 일부 효소가 생물학적 촉매 능력을 상실했다는 것을 알게 되었으며, 이는 종종 유사효소의 [[아미노산]] 서열과 특이한 유사촉매(pseudocatalytic) 특성에 기인한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Murphy JM, Farhan H, Eyers PA | year = 2017 | title = Bio-Zombie: the rise of pseudoenzymes in biology | url = | journal = Biochem Soc Trans | volume = 45 | issue = 2| pages = 537–544 | doi=10.1042/bst20160400| pmid = 28408493 }}</ref><ref name="pmid24107129">{{저널 인용|vauthors=Murphy JM, et al. | title = A robust methodology to subclassify pseudokinases based on their nucleotide-binding properties | journal = Biochemical Journal | volume = 457 | issue = 2 | pages = 323–334 | year = 2014 | pmid = 24107129 | doi = 10.1042/BJ20131174| pmc=5679212}}</ref>

효소는 5,000가지 이상의 [[생화학]] 반응 유형들을 촉매하는 것으로 알려져 있다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Schomburg I, Chang A, Placzek S, Söhngen C, Rother M, Lang M, Munaretto C, Ulas S, Stelzer M, Grote A, Scheer M, Schomburg D | title = BRENDA in 2013: integrated reactions, kinetic data, enzyme function data, improved disease classification: new options and contents in BRENDA | journal = Nucleic Acids Research | volume = 41 | issue = Database issue | pages = D764–72 | date = January 2013 | pmid = 23203881 | pmc = 3531171 | doi = 10.1093/nar/gks1049 }}</ref> 대부분의 효소들은 [[단백질]]이지만, 일부 효소들은 촉매 기능을 가지고 있는 RNA 분자이다. 촉매 기능을 가지고 있는 RNA를 [[리보자임]]이라고 한다. 효소의 특이성은 독특한 3차원 구조에서 비롯된다.

다른 촉매들과 마찬가지로, 효소는 화학 반응의 활성화 에너지를 낮춤으로써 [[반응 속도]]를 증가시킨다. 어떤 효소들은 기질을 생성물로 전환시키는 것을 수백만 배 더 빨리 일어나게 할 수 있다. 극단적인 예로는 [[오로티딘 일인산 탈카복실화효소]]가 있는데, 이 효소는 수백만 년이 걸릴 수 있는 반응을 [[밀리초|밀리세컨드]] 단위로 일어나게 한다.<ref name="radzicka">{{저널 인용| vauthors = Radzicka A, Wolfenden R | title = A proficient enzyme | journal = Science | volume = 267 | issue = 5194 | pages = 90–931 | date = January 1995 | pmid = 7809611 | doi=10.1126/science.7809611| bibcode = 1995Sci...267...90R }}</ref><ref name="pmid17889251">{{저널 인용| vauthors = Callahan BP, Miller BG | title = OMP decarboxylase—An enigma persists | journal = Bioorganic Chemistry | volume = 35 | issue = 6 | pages = 465–9 | date = December 2007 | pmid = 17889251 | doi = 10.1016/j.bioorg.2007.07.004 }}</ref> 화학적으로 효소는 다른 촉매들과 같아서 화학 반응에서 소모되지 않으며 반응의 [[화학 평형|평형]]을 변화시키지도 않는다. 효소는 훨씬 더 특이적이라는 점에서 대부분의 다른 촉매들과 다르다. 효소의 활성은 다른 분자에 의해 영향을 받을 수 있다. [[효소 저해제|저해제]]는 효소의 활성을 감소시키는 분자인 반면, [[효소 활성화제|활성화제]]는 효소의 활성을 증가시키는 분자이다. 많은 [[약]]과 [[독]]은 효소 저해제이다. 효소의 활성은 최적 [[온도]]와 [[수소 이온 농도 지수|pH]] 범위 밖에서 현저하게 감소하며, 많은 효소들은 과도한 열에 노출되면 영구적으로 [[변성 (생화학)|변성]]되어 구조와 촉매 특성을 상실하게 된다.

예를 들어 어떤 효소들은 [[항생제]]의 합성에 상업적으로 사용된다. 일부 가정용 제품들은 화학 반응의 속도를 높이기 위해 효소를 사용한다. 생물학적 [[세탁 세제]]에 들어 있는 효소는 옷에 묻은 [[단백질]], [[녹말]], [[지방]]의 얼룩을 분해하고, 고기 연화제에 들어 있는 효소는 단백질들을 더 작은 분자들로 분해하여 고기를 씹기 쉽게 만든다.

== 어원과 역사 ==
[[파일:Eduardbuchner.jpg|alt=Photograph of Eduard Buchner.|섬네일|180px|왼쪽|[[에두아르트 부흐너]]]]
18세기 말과 19세기 초에 [[위 (해부학)|위]] 분비물에 의한 [[고기]]의 소화<ref name="Reaumur1752">{{저널 인용| vauthors = de Réaumur RA | year = 1752 | title = Observations sur la digestion des oiseaux|journal = Histoire de l'Academie Royale des Sciences | volume = 1752 | pages = 266, 461 }}</ref> 및 식물 추출물과 [[침]]에 의해 [[녹말]]이 당으로 전환된다는 것은 알려져 있었지만, 이러한 현상이 일어나는 메커니즘은 밝혀져 있지 않았다.<ref>{{서적 인용| url = http://etext.lib.virginia.edu/toc/modeng/public/Wil4Sci.html | last = Williams | first = Henry Smith | title = A History of Science: in Five Volumes''. ''Volume IV: Modern Development of the Chemical and Biological Sciences | publisher = Harper and Brothers | year = 1904 | name-list-format = vanc }}</ref>

[[프랑스]]의 화학자 [[앙셀름 파얜]]은 1833년에 [[다이아스테이스]]라고 불리는 효소를 최초로 발견하였다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Payen A, Persoz JF | year = 1833 | title = Mémoire sur la diastase, les principaux produits de ses réactions et leurs applications aux arts industriels | language = French | trans-title = Memoir on diastase, the principal products of its reactions, and their applications to the industrial arts | journal = Annales de chimie et de physique | series = 2nd | volume = 53 | url = https://books.google.com/?id=Q9I3AAAAMAAJ&pg=PA73 | pages = 73–92}}</ref> 수십년 후에 [[루이 파스퇴르]]는 [[효모]]에 의한 [[에탄올 발효|알코올 발효]]를 연구할 때 [[발효]]가 발효소(ferment)라고 불리는 효모 세포 내에 포함된 [[생기론|생명력]]에 의해 촉매된다고 결론 짓고, 이러한 일이 살아 있는 생명체 내에서만 가능하다고 생각했다. 파스퇴르는 "알코올 발효는 세포의 죽음이나 부패가 아닌 효모 세포의 생명 및 구성과 상호연관된 작용이다"라고 기록했다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Manchester KL | title = Louis Pasteur (1822–1895)–chance and the prepared mind | journal = Trends in Biotechnology | volume = 13 | issue = 12 | pages = 511–5 | date = December 1995 | pmid = 8595136 | doi = 10.1016/S0167-7799(00)89014-9 }}</ref>

1877년에 [[독일]]의 생리학자 [[빌헬름 퀴네]]는 이러한 과정을 설명하기 위해 [[그리스어]] "ἔνζυμον" ([[독일어]]로 "leavened"라는 의미로 [[영어]]로 "in yeast"라는 뜻)에서 유래한 "효소(enzyme)"라는 용어를 만들었다.<ref>Kühne coined the word "enzyme" in: {{저널 인용| vauthors = Kühne W | year = 1877 | url = https://books.google.com/?id=jzdMAAAAYAAJ&pg=PA190 | language = German | title = Über das Verhalten verschiedener organisirter und sog. ungeformter Fermente | trans-title = On the behavior of various organized and so-called unformed ferments | journal = Verhandlungen des Naturhistorisch-medicinischen Vereins zu Heidelberg | series = new series | volume = 1 | issue = 3 | pages = 190–193 }} Relevant passage on page 190: ''"Um Missverständnissen vorzubeugen und lästige Umschreibungen zu vermeiden schlägt Vortragender vor, die ungeformten oder nicht organisirten Fermente, deren Wirkung ohne Anwesenheit von Organismen und ausserhalb derselben erfolgen kann, als ''Enzyme'' zu bezeichnen."'' (Translation: In order to obviate misunderstandings and avoid cumbersome periphrases, [the author, a university lecturer] suggests designating as "enzymes" the unformed or not organized ferments, whose action can occur without the presence of organisms and outside of the same.)</ref> 한자 번역어인 효소(酵素)는 "효모(酵母, yeast)에 들어있는 어떤 요소(要素)"라는 뜻이다. 효소라는 단어는 나중에 [[펩신]]과 같은 살아있지 않는 것들을 지칭하는데 사용되었으며, 발효소(ferment)는 생명체에 의해 생성된 화학적 활성을 지칭하는데 사용되었다.<ref>{{서적 인용| editor1-first = John L. | editor1-last = Heilbron | title = The Oxford Companion to the History of Modern Science | first1 = Frederic Lawrence | last1 = Holmes | chapter = Enzymes | page = 270 | chapterurl = https://books.google.com/books?id=abqjP-_KfzkC&pg=PA270&dq=history+of+enzymes+ferment+living+organisms | publisher = Oxford University Press | location = Oxford | year = 2003 | name-list-format = vanc }}</ref>

1897년에 [[에두아르트 부흐너]]는 효모 추출물의 연구에 대한 그의 첫 번째 논문을 제출했다. [[베를린 훔볼트 대학교]]에서 행해진 일련의 실험에서 부흐너는 혼합물에 살아있는 효모 세포가 없을 때에도 "효모 추출물에 의해" 당이 발효된다는 것을 발견했다.<ref name="urlEduard Buchner - Biographical">{{웹 인용| url = http://nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/1907/buchner-bio.html | title = Eduard Buchner | work = Nobel Laureate Biography | publisher = Nobelprize.org | accessdate = 23 February 2015 }}</ref> 부흐너는 설탕([[수크로스]])을 발효시키는 효소를 "치메이스(zymase)"라고 이름지었다.<ref name="urlEduard Buchner - Nobel Lecture: Cell-Free Fermentation">{{웹 인용| url = http://nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/1907/buchner-lecture.html | title = Eduard Buchner – Nobel Lecture: Cell-Free Fermentation | year = 1907 | work = Nobelprize.org | accessdate = 23 February 2015 }}</ref> 부흐너는 "그의 생화학적 연구와 무세포 발효의 발견"에 대한 공로로 1907년에 [[노벨 화학상]]을 수상했다. 부흐너의 예를 따라 효소는 일반적으로 그 효소가 수행하는 반응에 따라 명명된다. 보통 접미사 "-ase"는 [[반응물|기질]]의 이름 뒤에 붙이거나(예: [[락테이스]]는 [[락토스]](젖당) 분해효소이다), 반응의 유형(예: [[DNA 중합효소]]는 DNA 중합체를 형성한다)에 따른다.<ref>The naming of enzymes by adding the suffix "-ase" to the substrate on which the enzyme acts, has been traced to French scientist Émile Duclaux (1840–1904), who intended to honor the discoverers of diastase – the first enzyme to be isolated – by introducing this practice in his book {{서적 인용| author = Duclaux E | title = Traité de microbiologie: Diastases, toxines et venins | language = French | trans-title = Microbiology Treatise: diastases, toxins and venoms | year = 1899 | publisher = Masson and Co | location = Paris, France | url = https://books.google.com/books?id=Kp9EAAAAQAAJ&printsec=frontcover }} See Chapter 1, especially page 9.</ref>

효소의 생화학적 정체는 1900년대 초에 이르기까지 여전히 알려지지 않았다. 많은 과학자들은 효소의 활성이 단백질과 관련되어 있다고 지적했지만 몇몇 과학자들은(노벨 화학상 수상자인 [[리하르트 빌슈테터]] 같은) 단백질이 효소의 운반체일 뿐이며, 단백질 자체는 촉매 작용을 할 수 없다고 주장했다.<ref name = "Willstätter_1927">{{저널 인용| vauthors = Willstätter R | title = Faraday lecture. Problems and methods in enzyme research | journal = Journal of the Chemical Society (Resumed) | date = 1927 | pages = 1359–1381 | doi = 10.1039/JR9270001359 }} quoted in {{저널 인용 | vauthors = Blow D | title = So do we understand how enzymes work? | journal = Structure | volume = 8 | issue = 4 | pages = R77–R81 | date = April 2000 | pmid = 10801479 | doi = 10.1016/S0969-2126(00)00125-8 | url = http://cmgm3.stanford.edu/biochem/sb241/Herschlag_lectures/papers/Blow.pdf | 확인날짜 = 2019-09-19 | 보존url = https://web.archive.org/web/20160304090045/http://cmgm3.stanford.edu/biochem/sb241/Herschlag_lectures/papers/Blow.pdf | 보존날짜 = 2016-03-04 | url-status = dead }}</ref> 그러나 1926년에 [[제임스 B. 섬너]]는 [[유레이스]](요소가수분해효소)가 순수 단백질이며 결정화할 수 있음을 밝혀냈고, 1937년에 [[카탈레이스]]도 마찬가지임을 보여주었다. 순수 단백질이 효소일 수 있다는 결론은 소화 효소인 [[펩신]], [[트립신]], [[키모트립신]]을 연구한 [[존 하워드 노스럽]], [[웬들 메러디스 스탠리]]에 의해 결정적으로 증명되었다. 제임스 B. 섬너, 존 하워드 노스럽, 웬들 메러디스 스탠리는 1946년에 노벨 화학상을 공동 수상했다.<ref name="urlThe Nobel Prize in Chemistry 1946">{{웹 인용| url = http://nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/1946/ | title = Nobel Prizes and Laureates: The Nobel Prize in Chemistry 1946 | work = Nobelprize.org | accessdate = 23 February 2015 }}</ref>

효소가 결정화될 수 있다는 발견으로 과학자들은 마침내 [[X선 결정학]]으로 효소의 구조를 밝혀낼 수 있게 되었다. 이러한 시도는 [[눈물]], [[침]], [[달걀 흰자]]에서 발견되며 일부 세균의 외막을 분해하는 효소인 [[라이소자임]]에 대해 처음으로 수행되었으며, 라이소자임의 구조는 [[데이비드 칠턴 필립스]]가 이끈 연구진에 의해 밝혀졌고, 1965년에 발표되었다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Blake CC, Koenig DF, Mair GA, North AC, Phillips DC, Sarma VR | title = Structure of hen egg-white lysozyme. A three-dimensional Fourier synthesis at 2 Ångström resolution | journal = Nature | volume = 206 | issue = 4986 | pages = 757–61 | date = May 1965 | pmid = 5891407 | doi = 10.1038/206757a0 | bibcode = 1965Natur.206..757B }}</ref> 이렇게 밝혀진 라이소자임의 고해상도 구조는 [[구조생물학]]의 시작과 효소가 원자 수준에서 어떻게 작동하는지 이해하려는 노력의 성과를 보여준다.<ref name="pmid10390620">{{저널 인용| vauthors = Johnson LN, Petsko GA | title = David Phillips and the origin of structural enzymology | journal = Trends Biochem. Sci. | volume = 24 | issue = 7 | pages = 287–9 | year = 1999 | pmid = 10390620 | doi = 10.1016/S0968-0004(99)01423-1 }}</ref>

== 명명 규칙 ==
효소의 이름은 보통 효소의 기질이나 효소가 촉매하는 화학 반응에서 유래된 단어 끝에 접미사 "-에이스(-ase)"를 붙여서 짓는다.<ref name="Stryer_2002" /> [[락테이스]](lactase), [[알코올 탈수소효소]](alcohol dehydrogenase), [[DNA 중합효소]](DNA polymerase) 등이 그 예이다. 동일한 화학 반응을 촉해하는 서로 다른 효소들을 [[아이소자임|동질효소]]라고 한다.<ref name = "Stryer_2002"/>

[[국제 생화학·분자생물학 연합]](IUBMB)은 효소에 대한 [[명명법]]인 [[효소 번호|EC 번호]]를 고안했다. 각각의 효소는 "효소 위원회(Enzyme Commission)"를 의미하는 "EC"가 앞에 붙는 일련의 4개의 숫자로 기술된다. 4개의 숫자 중 첫 번째 숫자는 효소의 [[반응 메커니즘]]에 따라 크게 분류되는 부류를 의미한다.<ref name="url_Enzyme_Classification">{{웹 인용| url = http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/rules.html | title = Classification and Nomenclature of Enzymes by the Reactions they Catalyse | author = Nomenclature Committee | work = International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB) | publisher = School of Biological and Chemical Sciences, Queen Mary, University of London | access-date = 6 March 2015 | archive-url = https://web.archive.org/web/20150317054348/http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/rules.html | archive-date = 17 March 2015 | url-status = dead | df = dmy-all }}</ref>

최상위 분류 체계는 다음과 같다.
* EC 1, [[산화 환원 효소]]: [[산화·환원 반응]]을 촉매한다.
* EC 2, [[전달 효소|전이 효소]]: 한 기질의 [[작용기]](예: [[메틸기]], 인산기)를 다른 기질로 옮기는 반응을 촉매한다.
* EC 3, [[가수 분해 효소]]: 물을 첨가하여 기질을 분해하는 반응을 촉매한다.
* EC 4, [[분해 효소]]: 가수분해와 산화 이외의 방법으로 다양한 결합을 분해하는 반응을 촉매한다.
* EC 5, [[이성질화 효소]]: 단일 분자 내에서 원자 배열을 바꾸어 [[이성질체]]로 만드는 반응을 촉매한다.
* EC 6, [[연결 효소]]: 에너지를 소비해서 두 개의 기질을 서로 연결시키는 반응을 촉매한다.

이러한 분류들은 기질, 생성물 및 [[반응 메커니즘]]과 같은 다른 특징들에 의해 보다 세분화된다. 효소는 4개의 숫자로 지정된다. 예를 들어, [[헥소키네이스]](EC 2.7.1.1)에서 첫 번째 숫자 2는 최상위 분류인 전이효소를, 두 번째 숫자 7은 인산기 전이효소를, 세 번째 숫자 1은 하이드록시기를 수용체로 가지는 인산기 전이효소를, 네 번째 숫자 1은 인산기의 수용체인 [[글루코스|D-글루코스]]를 나타낸다.<ref>{{웹 인용| title = EC 2.7.1.1 | url = http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/1/1.html | author = Nomenclature Committee | work = International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB) | publisher = School of Biological and Chemical Sciences, Queen Mary, University of London | access-date = 6 March 2015 | archive-url = https://web.archive.org/web/20141201224835/http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/7/1/1.html | archive-date = 1 December 2014 | url-status = dead | df = dmy-all }}</ref>

== 구조 ==
[[파일:Q10 graph c.svg|섬네일|400px|효소가 관여하는 화학 반응에서 최적 온도가 될 때까지는 온도(Q10 계수)가 높아짐에 따라 반응 속도가 빨라지지만, 최적 온도보다 온도가 높아지면 활성 부위의 입체 구조가 [[변성 (생화학)|변성]]되어 기질과 반응하지 못하므로 [[반응 속도]]는 급격히 느려진다.|alt=A graph showing that reaction rate increases exponentially with temperature until denaturation causes it to decrease again.]]

{{참고|단백질의 구조}}
효소는 일반적으로 단독으로 또는 더 큰 복합체로 작용하는 [[구상 단백질]]이다. 아미노산의 서열은 효소의 촉매 활성을 결정하는 구조를 지정한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Anfinsen CB | title = Principles that govern the folding of protein chains | journal = Science | volume = 181 | issue = 4096 | pages = 223–30 | date = July 1973 | pmid = 4124164 | doi = 10.1126/science.181.4096.223 | bibcode = 1973Sci...181..223A }}</ref> 구조가 기능을 결정하지만, 새로운 효소 활성은 아직 구조만으로는 예측할 수 없다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Dunaway-Mariano D | title = Enzyme function discovery | journal = Structure | volume = 16 | issue = 11 | pages = 1599–600 | date = November 2008 | pmid = 19000810 | doi = 10.1016/j.str.2008.10.001 }}</ref> 효소 구조는 가열하거나 화학적 변성 물질에 노출될 때 접힘이 풀리며([[변성 (생화학)|변성]]), 이러한 구조의 파괴는 전형적으로 효소 활성의 소실을 야기한다.<ref>{{서적 인용| last1 = Petsko | first1 = Gregory A. | last2 = Ringe | first2 = Dagmar | name-list-format = vanc | title = Protein structure and function | date = 2003 | publisher = New Science | location = London | isbn=978-1405119221 | chapter = Chapter 1: From sequence to structure | chapterurl = https://books.google.com/books?id=2yRDWkHhN9QC&pg=PA27&dq=Protein+Denaturation+unfold+loss+of+function | page = 27 }}</ref> 효소의 변성은 일반적으로 효소의 최적 온도보다 높은 온도와 관련이 있다. 그 결과, [[온천]]과 같은 화산 환경에 사는 세균으로부터 얻은 효소는 고온에서 기능을 할 수 있는 능력 때문에 매우 중요하며, 효소 촉매 반응을 매우 빠른 속도로 일어날 수 있게 한다.

효소는 보통 기질보다 훨씬 더 크다. 효소의 크기는 단지 62개의 아미노산 잔기를 가지고 있는 [[단량체]]인 4-옥살로크로톤산 호변이성질화효소<ref>{{저널 인용| vauthors = Chen LH, Kenyon GL, Curtin F, Harayama S, Bembenek ME, Hajipour G, Whitman CP | title = 4-Oxalocrotonate tautomerase, an enzyme composed of 62 amino acid residues per monomer | journal = The Journal of Biological Chemistry | volume = 267 | issue = 25 | pages = 17716–21 | date = September 1992 | pmid = 1339435 }}</ref>로부터 2,500개가 넘는 [[아미노산]] [[잔기]]를 가지고 있는 동물의 [[지방산 생성효소]]까지 다양하다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Smith S | title = The animal fatty acid synthase: one gene, one polypeptide, seven enzymes | journal = FASEB Journal | volume = 8 | issue = 15 | pages = 1248–59 | date = December 1994 | pmid = 8001737 | doi = 10.1096/fasebj.8.15.8001737 }}</ref> 효소 구조의 작은 부분(약 2~4개의 아미노산)만이 촉매 작용에 직접적으로 관여하는데, 이 부위를 촉매 부위라고 한다.<ref>{{웹 인용 | url = http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CSA/ | title = The Catalytic Site Atlas | publisher = The European Bioinformatics Institute | accessdate = 4 April 2007 | archive-date = 2013-08-03 | archive-url = https://web.archive.org/web/20130803032349/http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CSA/ | url-status =  }}</ref> 이러한 촉매 부위는 잔기들이 기질을 배향시키는 하나 이상의 [[결합 부위]] 옆에 위치한다. 촉매 부위와 결합 부위는 함께 효소의 [[활성 부위]]를 구성한다. 효소 구조의 나머지 대부분은 활성 부위의 정확한 방향 및 역학 관계를 유지하는 역할을 한다.<ref name = "Suzuki_2015_7">{{서적 인용| author = Suzuki H | title = How Enzymes Work: From Structure to Function | publisher = CRC Press | location = Boca Raton, FL | year = 2015 | isbn = 978-981-4463-92-8 | chapter = Chapter 7: Active Site Structure | pages = 117–140 }}</ref>

일부 효소에서는 촉매 작용에 아미노산이 직접적으로 관여하지 않는 대신에 [[보조 인자]]와 결합하고 그 방향을 정하는 역할을 한다.<ref name="Suzuki_2015_7" /> 효소 구조는 또한 작은 분자의 결합이 효소의 활성을 증가 또는 감소시키는 [[입체구조적 변화]]를 일으키는 [[다른 자리 입체성 조절|다른 자리 입체성 조절 부위]]를 포함할 수 있다.<ref>{{서적 인용| author = Krauss G | title = Biochemistry of Signal Transduction and Regulation | date = 2003 | publisher = Wiley-VCH | location = Weinheim | isbn = 9783527605767 | edition = 3rd | pages = 89–114 | chapter = The Regulations of Enzyme Activity | chapterurl = https://books.google.com/books?id=iAvu2XRLnfYC&pg=PA91&dq=enzyme+metabolic+pathways+feedback+regulation}}</ref>

리보자임이라고 불리는 소수의 [[RNA]] 기반 생물학적 촉매가 존재하며, [[리보자임]]은 단독으로 또는 단백질과 복합체를 형성하여 작용할 수 있다. 리보자임들 중 가장 일반적인 것은 촉매 기능을 가진 RNA와 단백질의 복합체인 [[리보솜]]이다.<ref name = "Stryer_2002"/>

== 반응 메커니즘 ==
[[파일:Enzyme structure.svg|섬네일|400px|효소의 구조 및 [[라이소자임]]의 구성의 예. 결합 부위는 파란색, 촉매 부위는 빨간색, 기질인 [[펩티도글리칸]]은 검은색으로 표시되어 있다. ({{PDB|9LYZ}})|alt=Lysozyme displayed as an opaque globular surface with a pronounced cleft which the substrate depicted as a stick diagram snuggly fits into.]]

=== 기질의 결합 ===
효소는 화학 반응을 촉매하기 전에 기질과 결합해야 한다. 효소는 보통 어떤 [[반응물|기질]]과 결합하고, 기질의 화학 반응을 촉매하는데 있어서 특이성이 있다. 특이성이란 기질 및 기질과 경쟁하는 분자들을 식별할 수 있는 효소의 능력을 말한다. 특이성은 상보적인 구조, 전하 및 [[친수성]]/[[소수성]]을 갖는 포켓에 기질이 결합함으로써 충족된다. 따라서 효소는 [[화학선택성]], [[위치선택성]], [[입체특이성]]이 매우 비슷한 기질 분자들을 구별할 수 있다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Jaeger KE, Eggert T | title = Enantioselective biocatalysis optimized by directed evolution | journal = Current Opinion in Biotechnology | volume = 15 | issue = 4 | pages = 305–13 | date = August 2004 | pmid = 15358000 | doi = 10.1016/j.copbio.2004.06.007 }}</ref>

가장 높은 특이성과 정확성을 보여주는 일부 효소들은 [[게놈]]의 복제 및 [[유전자 발현|발현]]에 관여한다. 이들 효소들 중 일부는 "[[교정 (생물학)|교정]]" 기작을 가지고 있다. 여기서 [[DNA 중합효소]]와 같은 효소는 첫 번째 단계에서 반응을 촉매한 다음, 두 번째 단계에서 생성물이 올바른지를 확인한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Shevelev IV, Hübscher U | title = The 3' 5' exonucleases | journal = Nature Reviews Molecular Cell Biology | volume = 3 | issue = 5 | pages = 364–76 | date = May 2002 | pmid = 11988770 | doi = 10.1038/nrm804 }}</ref> 이러한 두 단계 반응은 높은 정확도를 가지고 있는 포유류의 DNA 중합효소에서 평균적으로 1억 회의 반응당 오류 횟수가 1회 미만의 오류률을 나타내도록 한다.<ref name = "Stryer_2002"/> 이와 유사한 교정 기작은 [[RNA 중합효소]],<ref>{{저널 인용| vauthors = Zenkin N, Yuzenkova Y, Severinov K | title = Transcript-assisted transcriptional proofreading | journal = Science | volume = 313 | issue = 5786 | pages = 518–20 | date = July 2006 | pmid = 16873663 | doi = 10.1126/science.1127422 | bibcode = 2006Sci...313..518Z }}</ref> [[아미노아실 tRNA 합성효소]],<ref>{{저널 인용| vauthors = Ibba M, Soll D | title = Aminoacyl-tRNA synthesis | journal = Annual Review of Biochemistry | volume = 69 | pages = 617–50 | pmid = 10966471 | doi = 10.1146/annurev.biochem.69.1.617 | year=2000}}</ref> [[리보솜]]<ref>{{저널 인용| vauthors = Rodnina MV, Wintermeyer W | title = Fidelity of aminoacyl-tRNA selection on the ribosome: kinetic and structural mechanisms | journal = Annual Review of Biochemistry | volume = 70 | pages = 415–35 | pmid = 11395413 | doi = 10.1146/annurev.biochem.70.1.415 | year=2001}}</ref>에서도 발견된다.

반대로, 일부 효소들은 광범위한 기질 특이성을 가지며, 다양한 생리학적 관련 기질들에 작용하는 [[효소 다중기능성]](enzyme promiscuity)을 나타낸다. 많은 효소들은 우연하게 일어나는 작은 부차적인 활성(예: [[중립 진화 이론|분자진화의 중립설]])을 가지고 있는데, 이것은 새로운 기능의 진화적 선택에 대한 출발점이 될 수 있다.<ref name=Tawfik10>{{저널 인용| vauthors = Khersonsky O, Tawfik DS | title = Enzyme promiscuity: a mechanistic and evolutionary perspective | journal = Annual Review of Biochemistry | volume = 79 | pages = 471–505 | pmid = 20235827 | pmc = | doi = 10.1146/annurev-biochem-030409-143718 | year=2010}}</ref><ref>{{저널 인용| vauthors = O'Brien PJ, Herschlag D | title = Catalytic promiscuity and the evolution of new enzymatic activities | journal = Chemistry & Biology | volume = 6 | issue = 4 | pages = R91–R105 | date = April 1999 | pmid = 10099128 | doi = 10.1016/S1074-5521(99)80033-7 }}</ref>

[[파일:Hexokinase induced fit.svg|alt=Hexokinase displayed as an opaque surface with a pronounced open binding cleft next to unbound substrate (top) and the same enzyme with more closed cleft that surrounds the bound substrate (bottom)|섬네일|400px|효소는 기질이 결합하면 유도 적합에 의해 형태를 바꿔 효소-기질 복합체를 형성한다. [[헥소키네이스]]는 기질인 [[아데노신 삼인산]](ATP)과 [[자일로스]]를 덮는 커다란 유도 적합 움직임을 일으킨다. 결합 부위는 파란색, 기질은 검은색, 보조 인자인 [[마그네슘|Mg<sup>2+</sup>]]는 노란색으로 표시되어 있다. ({{PDB|2E2N}}, {{PDB|2E2Q}})]]

==== 자물쇠와 열쇠 모델 ====
관찰된 효소의 특이성을 설명하기 위해 [[에밀 피셔]]는 1894년에 효소와 기질이 서로 정확하게 들어맞는 상호보완적이고 기하학적으로 특이적인 형태를 가지고 있다고 제안했다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Fischer E | year = 1894 | title = Einfluss der Configuration auf die Wirkung der Enzyme | language = German | trans-title = Influence of configuration on the action of enzymes | journal=Berichte der Deutschen Chemischen Gesellschaft zu Berlin | volume = 27 | issue = 3 | pages = 2985–93 | url = http://gallica.bnf.fr/ark:/12148/bpt6k90736r/f364.chemindefer|doi=10.1002/cber.18940270364 }} From page 2992: ''"Um ein Bild zu gebrauchen, will ich sagen, dass Enzym und Glucosid wie Schloss und Schlüssel zu einander passen müssen, um eine chemische Wirkung auf einander ausüben zu können."'' (To use an image, I will say that an enzyme and a glucoside [i.e., glucose derivative] must fit like a lock and key, in order to be able to exert a chemical effect on each other.)</ref> 이러한 모델을 보통 자물쇠와 열쇠 모델이라고 한다.<ref name="Stryer_2002" /> 자물쇠와 열쇠 모델은 효소의 특이성을 설명하지만, 효소가 반응을 촉매하면서 달성되는 [[전이 상태]]의 안정성은 설명하지 못한다.<ref name="Cooper_2000">{{서적 인용|author = Cooper GM | title = The Cell: a Molecular Approach | date = 2000 | publisher = ASM Press | location = Washington (DC ) | isbn = 0-87893-106-6 | edition = 2nd | chapter = Chapter 2.2: The Central Role of Enzymes as Biological Catalysts | chapterurl = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9921/}}</ref>

==== 유도 적합 모델 ====
1958년에 다니엘 코쉬랜드(Daniel Koshland)는 [[자물쇠]]와 열쇠 모델에 대한 수정을 제안했다. 효소는 다소 유연한 구조이기 때문에 활성 부위는 기질이 효소와 상호작용을 함에 따라 계속해서 구조를 바꿀 수 있다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Koshland DE | title = Application of a Theory of Enzyme Specificity to Protein Synthesis | journal = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | volume = 44 | issue = 2 | pages = 98–104 | date = February 1958 | pmid = 16590179 | pmc = 335371 | doi = 10.1073/pnas.44.2.98 | bibcode = 1958PNAS...44...98K }}</ref> 결과적으로 기질은 효소의 고정된 활성 부위에 단순히 결합하는 것이 아니다. 활성 부위를 구성하는 아미노산 [[곁사슬]]들은 효소가 촉매 작용을 수행할 수 있는 정확한 위치로 자리잡게 된다. [[글리코시데이스]]와 같은 일부 경우에 기질 [[분자]]도 활성 부위로 들어가면서 모양이 약간 변화하기도 한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Vasella A, Davies GJ, Böhm M | title = Glycosidase mechanisms | journal = Current Opinion in Chemical Biology | volume = 6 | issue = 5 | pages = 619–29 | date = October 2002 | pmid = 12413546 | doi = 10.1016/S1367-5931(02)00380-0 }}</ref> 활성 부위는 기질이 완전하게 결합할 때까지 계속해서 변화하며 완전히 결합되면 최종적인 형태와 전하 분포가 결정된다.<ref>{{서적 인용| last = Boyer | first = Rodney | title = Concepts in Biochemistry | url = https://archive.org/details/conceptsinbioche0002boye | edition = 2nd | publisher = John Wiley & Sons, Inc. | location = New York, Chichester, Weinheim, Brisbane, Singapore, Toronto. | isbn = 0-470-00379-0 | pages=[https://archive.org/details/conceptsinbioche0002boye/page/n166 137]–8 | chapter = Chapter 6: Enzymes I, Reactions, Kinetics, and Inhibition | year = 2002 | oclc = 51720783 | name-list-format = vanc}}</ref> 유도 적합은 [[입체구조적 교정]] 기작을 통해 분자 간의 경쟁 및 혼선이 존재하는 경우에 분자 인식의 충실도를 향상시킬 수 있다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Savir Y, Tlusty T | title = Conformational proofreading: the impact of conformational changes on the specificity of molecular recognition | journal = PLoS ONE | volume = 2 | issue = 5 | pages = e468 | year = 2007 | pmid = 17520027 | pmc = 1868595 | doi = 10.1371/journal.pone.0000468 | url = http://www.weizmann.ac.il/complex/tlusty/papers/PLoSONE2007.pdf | editor1-last = Scalas | editor1-first = Enrico | name-list-format = vanc | bibcode = 2007PLoSO...2..468S | access-date = 22 August 2010 | archive-url = https://web.archive.org/web/20110514055337/http://www.weizmann.ac.il/complex/tlusty/papers/PLoSONE2007.pdf | archive-date = 14 May 2011 | url-status = dead }}</ref>

=== 촉매작용 ===
{{참고|효소 촉매작용|전이 상태 이론}}
효소는 여러 가지 방법으로 [[활성화 에너지]]를 낮춤으로서 반응 속도를 높일 수 있다(ΔG<sup>‡</sup>, 깁스 자유 에너지).<ref name="Fersht_1985">{{서적 인용| author = Fersht A | title = Enzyme Structure and Mechanism | publisher = W.H. Freeman | location = San Francisco | year = 1985 | pages = 50–2 | isbn = 978-0-7167-1615-0}}</ref>
# 전이 상태를 안정화시킴:
#* 활성화 에너지를 낮추기 위해 전이 상태에서 상호보완적인 전하 분포로 환경을 조성한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Warshel A, Sharma PK, Kato M, Xiang Y, Liu H, Olsson MH | title = Electrostatic basis for enzyme catalysis | journal = Chemical Reviews | volume = 106 | issue = 8 | pages = 3210–35 | date = August 2006 | pmid = 16895325 | doi = 10.1021/cr0503106 }}</ref>
# 대체 반응 경로를 제공함:
#* 일시적으로 기질과 반응하여 공유 결합된 중간생성물을 형성하여 전이 상태에서의 활성화 에너지를 낮춘다.<ref>{{서적 인용| last1 = Cox | first1 = Michael M. | last2 = Nelson | first2 = David L. | name-list-format = vanc | title = Lehninger Principles of Biochemistry | url = https://archive.org/details/lehningerprincip0000nels | date = 2013 | publisher = W.H. Freeman | location = New York, N.Y. | isbn = 978-1464109621 | edition = 6th | chapter = Chapter 6.2: How enzymes work | page = [https://archive.org/details/lehningerprincip0000nels/page/n226 195] }}</ref>
# 기질의 바닥 상태를 불안정하게 만듦:
#* 결합된 기질을 전이 상태의 형태로 변형시켜 전이 상태에 도달하는데 필요로 하는 에너지를 감소시킨다.<ref name=PMID12947189>{{저널 인용| vauthors = Benkovic SJ, Hammes-Schiffer S | title = A perspective on enzyme catalysis | journal = Science | volume = 301 | issue = 5637 | pages = 1196–202 | date = August 2003 | pmid = 12947189 | doi = 10.1126/science.1085515 | bibcode = 2003Sci...301.1196B }}</ref>
#* 기질을 반응이 일어날 수 있는 적절한 위치에 배치시켜 반응 [[엔트로피]] 변화를 감소시킨다.<ref>{{서적 인용| author = Jencks WP | title = Catalysis in Chemistry and Enzymology | publisher = Dover | location = Mineola, N.Y | year = 1987 | isbn = 978-0-486-65460-7 }}</ref> 이 메커니즘이 촉매작용에 미치는 영향은 상대적으로 작다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Villa J, Strajbl M, Glennon TM, Sham YY, Chu ZT, Warshel A | title = How important are entropic contributions to enzyme catalysis? | journal = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | volume = 97 | issue = 22 | pages = 11899–904 | date = October 2000 | pmid = 11050223 | pmc = 17266 | doi = 10.1073/pnas.97.22.11899 | bibcode = 2000PNAS...9711899V }}</ref>

효소는 이러한 여러 가지 메커니즘을 동시에 사용할 수 있다. 예를 들어, [[트립신]]과 같은 [[프로테이스]]는 [[촉매 삼잔기]]를 사용하여 공유결합성 촉매작용을 수행하고, [[산소 음이온 구멍]]을 사용하여 전이 상태에서 [[전하]]의 축적을 안정화시키며, 기질인 물을 사용하여 [[가수분해]]를 수행한다.<ref>{{저널 인용|last=Polgár|first=L.|date=2005-07-07|title=The catalytic triad of serine peptidases|journal=Cellular and Molecular Life Sciences|language=en|volume=62|issue=19–20|pages=2161–2172|doi=10.1007/s00018-005-5160-x|pmid=16003488|issn=1420-682X}}</ref>

=== 동역학 ===
{{참고|단백질 동역학}}
효소는 경직되고, 정적인 구조가 아니다. 대신에 효소는 내부에 복잡한 역동적인 움직임을 가지고 있다. 즉, 개별 아미노산 잔기, 단백질 루프를 형성하는 잔기들의 그룹, 2차 구조의 단위, 심지어 전체 [[단백질 도메인]]과 같은 효소 구조의 일부분의 움직임을 의미한다. 이러한 움직임들은 [[열역학적 평형|평형]] 상태에서 상호 변환하는 약간 다른 구조의 입체 구조적 변화를 유발한다. 이와 같은 입체구조적 변화 내의 다른 상태들은 효소 기능의 다른 측면들과 연관될 수 있다. 예를 들어, [[다이하이드로폴산 환원효소]]의 상이한 입체 구조는 촉매 주기에서 기질의 결합, 촉매 작용 보조 인자의 방출, 생성물의 방출과 관련된다.<ref>{{저널 인용|vauthors=Ramanathan A, Savol A, Burger V, Chennubhotla CS, Agarwal PK |title=Protein conformational populations and functionally relevant substates |journal=Acc. Chem. Res. |volume=47 |issue=1 |pages=149–56 |year=2014 |pmid=23988159 |doi=10.1021/ar400084s |url=}}</ref>

=== 다른 자리 입체성 조절 ===
{{본문|다른 자리 입체성 조절}}
[[다른 자리 입체성 조절|다른 자리 입체성 조절 부위]]는 활성 부위와 구별되는 효소의 주머니로 세포 환경의 분자들과 결합한다. 이러한 분자들은 활성 부위로 전달되는 효소의 변형이나 동역학에서 입체 구조의 변화를 일으켜 효소의 반응 속도에 영향을 미친다.<ref>{{저널 인용 |vauthors=Tsai CJ, Del Sol A, Nussinov R |title=Protein allostery, signal transmission and dynamics: a classification scheme of allosteric mechanisms |journal=Mol Biosyst |volume=5 |issue=3 |pages=207–16 |year=2009 |pmid=19225609 |pmc=2898650 |doi=10.1039/b819720b |url=http://orbilu.uni.lu/bitstream/10993/16451/1/paper.pdf |access-date=2019-09-19 |archive-date=2021-01-01 |archive-url=https://web.archive.org/web/20210101082211/https://orbilu.uni.lu/bitstream/10993/16451/1/paper.pdf |url-status= }}</ref> 이와 같은 방식으로 다른 자리 입체성 조절 상호작용은 효소를 저해하거나 활성화시킬 수 있다. 효소의 [[대사 경로]]에서 [[대사 산물]]의 이전 단계 또는 이후 단계와의 다른 자리 입체성 조절 상호작용은 [[피드백]] 조절을 유발하고, 나머지 대사 경로를 통한 흐름에 따라 효소의 활성을 변화시킨다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Changeux JP, Edelstein SJ | title = Allosteric mechanisms of signal transduction | journal = Science | volume = 308 | issue = 5727 | pages = 1424–8 | date = June 2005 | pmid = 15933191 | doi = 10.1126/science.1108595 | bibcode = 2005Sci...308.1424C }}</ref>

== 보조 인자 ==
[[파일:Transketolase + TPP.png|섬네일|400px|alt=Thiamine pyrophosphate displayed as an opaque globular surface with an open binding cleft where the substrate and cofactor both depicted as stick diagrams fit into.|[[트랜스케톨레이스]]의 구조 및 티아민 피로인산의 구조. 보조 인자인 [[티아민 피로인산]]은 노란색, 기질인 [[자일룰로스 5-인산]]은 검은색으로 표시되어 있다. ({{PDB|4KXV}})]]

{{본문|보조 인자}}
일부 효소들은 단백질로만 이루어져 있다. 대다수의 효소들은 보조 인자라고 불리는 비단백질 분자를 효소의 활성을 위해 필요로 한다.<ref>{{웹 인용| url = http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/bioinorg/CD.html#34 | title = Glossary of Terms Used in Bioinorganic Chemistry: Cofactor | accessdate = 30 October 2007 | last = de Bolster | first = M.W.G. | year = 1997 | publisher = International Union of Pure and Applied Chemistry | name-list-format = vanc | archive-url = https://web.archive.org/web/20170121172848/http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/bioinorg/CD.html#34#34 | archive-date = 21 January 2017 | url-status = dead | df = dmy-all }}</ref> 보조 인자는 [[무기 화합물]](예: [[이온|금속 이온]], [[철-황 클러스터]]) 또는 [[유기 화합물]](예: [[플라빈기|플라빈]], [[헴]])일 수 있다. 이러한 보조 인자들은 여러 가지 목적으로 사용되는데, 예를 들어 금속 이온은 [[활성 부위]] 내에서 [[친핵체]]를 안정화시키는데 도움을 줄 수 있다.<ref>{{서적 인용|title=Fundamentals of Biochemistry |url=https://archive.org/details/fundamentalsofbi0000voet_k8p4 |last=Voet |first=Donald |last2=Voet |first2=Judith |last3=Pratt |first3=Charlotte | name-list-format = vanc |publisher=John Wiley & Sons, Inc. |year=2016 |isbn=978-1-118-91840-1 |location=Hoboken, New Jersey |pages=[https://archive.org/details/fundamentalsofbi0000voet_k8p4/page/n357 336]}}</ref> 유기 보조 인자는 일반적으로 반응이 끝나면 효소의 활성 부위에서 분리될 수 있는 [[조효소]]이거나, 효소와 강하게 결합되어 있는 [[보조 인자|보결분자단]]일 수 있다. 유기 보결분자단은 공유 결합될 수 있다(예: [[피루브산 카복실화효소]]에서의 [[비오틴]]).<ref name="pmid10470036">{{저널 인용| vauthors = Chapman-Smith A, Cronan JE | title = The enzymatic biotinylation of proteins: a post-translational modification of exceptional specificity | journal = Trends Biochem. Sci. | volume = 24 | issue = 9 | pages = 359–63 | year = 1999 | pmid = 10470036 | doi = 10.1016/s0968-0004(99)01438-3}}</ref>

보조 인자를 포함하고 있는 효소의 예로 [[탄산무수화효소]]가 있으며, 탄산무수화효소는 활성 부위의 일부분에 아연 보조 인자가 결합되어 있다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Fisher Z, Hernandez Prada JA, Tu C, Duda D, Yoshioka C, An H, Govindasamy L, Silverman DN, McKenna R | title = Structural and kinetic characterization of active-site histidine as a proton shuttle in catalysis by human carbonic anhydrase II | journal = Biochemistry | volume = 44 | issue = 4 | pages = 1097–115 | date = February 2005 | pmid = 15667203 | doi = 10.1021/bi0480279 }}</ref> 이렇게 강하게 결합된 이온 또는 분자는 일반적으로 활성 부위에서 발견되며, 촉매 작용에 관여한다.<ref name = "Stryer_2002"/> 예를 들어, 플라빈 및 헴 보조 인자는 [[산화환원 반응]]에 관여한다.<ref name = "Stryer_2002"/>

보조 인자를 필요로 하는 효소에서 보조 인자를 제외한 효소의 단백질 부분을 주효소(主酵素, apoenzyme)라고 한다. 주효소와 보조 인자가 결합해 완전한 효소 활성을 갖는 상태를 전효소(全酵素, holoenzyme)라고 한다. 또한 전효소라는 용어는 [[DNA 중합효소]]와 같은 여러 개의 단백질 소단위체를 가지고 있는 효소에 사용할 수도 있는데, 여기서 전효소는 효소 활성에 필요한 모든 소단위체들을 포함하고 있는 완전한 복합체를 의미한다.<ref name = "Stryer_2002"/>

=== 조효소 ===

조효소는 약하게 또는 강하게 효소와 결합할 수 있는 작은 유기 분자이다. 조효소는 어떤 효소에서 다른 효소로 작용기를 운반한다.<ref name = "Wagner_1975">{{서적 인용| author = Wagner AL | title = Vitamins and Coenzymes | url = https://archive.org/details/vitaminscoenzyme0000wagn | publisher = Krieger Pub Co | year = 1975 | isbn = 0-88275-258-8}}</ref> 이에 대한 예로는 [[니코틴아마이드 아데닌 다이뉴클레오타이드]](NAD<sup>+</sup>), [[니코틴아마이드 아데닌 다이뉴클레오타이드 인산]](NADP<sup>+</sup>) 및 아데노신 삼인산(ATP) 등이 있다. [[플라빈 모노뉴클레오타이드]](FMN), [[플라빈 아데닌 다이뉴클레오타이드]](FAD), [[티아민 피로인산]](TPP), [[테트라하이드로폴산]](THF)과 같은 일부 조효소들은 [[비타민]]으로부터 유래한다. 이러한 조효소들은 체내에서 [[신생합성]]으로 합성될 수 없으며, 밀접하게 관련된 화합물(비타민)은 반드시 식사를 통해 섭취해서 얻어야 한다. 조효소가 운반하는 작용기들은 다음과 같다.
* [[NAD+|NAD<sup>+</sup>]] 또는 [[NADP+|NADP<sup>+</sup>]]는 [[수소화물]](H<sup>−</sup>)을 운반한다.
* [[아데노신 삼인산|ATP]]는 인산기를 운반한다.
* [[조효소 A]]는 아세틸기를 운반한다.
* [[폴산]]은 폼일기, 메테닐기, 메틸기를 운반한다.
* [[S-아데노실메티오닌]]은 메틸기를 운반한다.<ref name = "Wagner_1975"/>

효소 작용의 결과로 조효소가 화학적으로 변하기 때문에 보조 효소를 다양한 효소들에 공통적인 특별한 종류의 기질 또는 두 번째 기질로 간주하는 것이 유용하다. 예를 들어, 약 1,000가지의 효소들이 조효소로 NADH를 사용하는 것으로 알려져 있다.<ref>{{웹 인용 | url = http://www.brenda-enzymes.org | title = BRENDA The Comprehensive Enzyme Information System | publisher = Technische Universität Braunschweig | accessdate = 23 February 2015 | 보존url = https://web.archive.org/web/20150506193454/http://www.brenda-enzymes.org/ | 보존날짜 = 2015-05-06 | url-status = dead }}</ref>

NADH 및 NADPH의 높은 가격은 산업적 생명공학 공정에서 보조인자 의존성 효소를 사용하는 데 있어 경제적인 관점에서 볼 때 단점입니다. 따라서 값싼 합성 생체 모방 보조 인자의 개발은 전략적으로 중요한 연구 과제입니다<ref>{{저널 인용|제목=Characterization of Biomimetic Cofactors According to Stability, Redox Potentials, and Enzymatic Conversion by NADH Oxidase from Lactobacillus pentosus|저널=ChemBioChem|성=Nowak|이름=Claudia|성2=Pick|이름2=André|url=https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cbic.201700258|날짜=2017-10-05|권=18|호=19|쪽=1944–1949|언어=en|doi=10.1002/cbic.201700258|issn=1439-4227|성3=Csepei|이름3=Lénárd‐István|성4=Sieber|이름4=Volker}}</ref>.

조효소는 대개 지속적으로 재생되며, 그 농도는 세포 내에서 일정 수준으로 유지된다. 예를 들어, NADPH는 [[오탄당 인산 경로]] 및 [[메티오닌 아데노실트랜스퍼레이스]]에 의한 S-아데노실메티오닌을 통해 재생된다. 이러한 지속적인 재생은 소량의 조효소가 매우 집중적으로 사용될 수 있음을 의미한다. 예를 들어, 사람이 하루에 사용하는 ATP의 총량은 자신의 몸무게보다 더 많다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Törnroth-Horsefield S, Neutze R | title = Opening and closing the metabolite gate | journal = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | volume = 105 | issue = 50 | pages = 19565–6 | date = December 2008 | pmid = 19073922 | pmc = 2604989 | doi = 10.1073/pnas.0810654106 | bibcode = 2008PNAS..10519565T }}</ref>

== 열역학 ==
[[파일:Enzyme catalysis energy levels 2.svg|섬네일|400px|alt=A two dimensional plot of reaction coordinate (x-axis) vs. energy (y-axis) for catalyzed and uncatalyzed reactions. The energy of the system steadily increases from reactants (x = 0) until a maximum is reached at the transition state (x = 0.5), and steadily decreases to the products (x = 1). However, in an enzyme catalysed reaction, binding generates an enzyme-substrate complex (with slightly reduced energy) then increases up to a transition state with a smaller maximum than the uncatalysed reaction.|[[화학 반응]]의 진행에 따른 에너지의 변화. 효소가 없을 때(점선), 기질은 [[전이 상태]]에 도달하기 위해 높은 [[활성화 에너지]]를 필요로 하고 그런 다음 낮은 에너지 상태의 생성물로 전환된다. 효소가 있을 때(실선), 효소는 기질과 결합(ES)한 다음, 전이 상태(ES<sup>‡</sup>)를 안정화시켜 최종적으로 방출되는 생성물을 생성(EP)하는데 필요한 활성화 에너지를 감소시킨다.]]

{{본문|열역학적 평형|화학 평형}}
모든 촉매와 마찬가지로, 효소는 반응의 [[화학 평형]]에는 영향을 주지 않는다. 효소가 존재할 때도 효소가 없을 때와 마찬가지로 같은 방향으로 반응이 진행되며, 단지 반응 속도가 더 빨라진다.<ref name = "Stryer_2002"/> 예를 들어, [[탄산무수화효소]]는 반응물의 농도에 따라 양방향으로 반응을 촉매한다.<ref>{{서적 인용|vauthors=McArdle WD, Katch F, Katch VL | title = Essentials of Exercise Physiology | date = 2006 | publisher = Lippincott Williams & Wilkins | location = Baltimore, Maryland | isbn = 978-0781749916 | pages = 312–3 | edition = 3rd | chapter = Chapter 9: The Pulmonary System and Exercise | chapterurl = https://books.google.com/books?id=L4aZIDbmV3oC&pg=PA313&dq=carbonic+anhydrase+lung+tissue+low+high+carbon+dioxide+equilibrium#v=onepage&q=carbonic%20anhydrase%20lung%20tissue%20low%20high%20carbon%20dioxide%20equilibrium}}</ref>

{{NumBlk|:| <chem>CO2{} + H2O ->[\text{탄산무수화효소}] H2CO3</chem> (조직에서 CO<sub>2</sub> 농도가 높을 때)|{{EquationRef|1}}}}

{{NumBlk|:| <chem>CO2{} + H2O <-[\text{탄산무수화효소}] H2CO3</chem> (폐에서 CO<sub>2</sub> 농도가 낮을 때)|{{EquationRef|2}}}}

반응 속도는 생성물로 전환시키기 위한 [[전이 상태]]를 형성하는데 필요한 [[활성화 에너지]]에 따라 달라진다. 효소는 반응의 활성화 에너지를 낮춤으로써 반응 속도를 증가시킨다. 첫째, 효소-기질 복합체(ES 복합체)를 형성하여 활성화 에너지를 낮춘다. 둘째, 효소는 효소가 없을 때의 반응에 비해 더 적은 에너지가 필요하도록 전이 상태를 안정화(ES<sup>‡</sup>)시킨다. 마지막으로 효소-생성물 복합체(EP 복합체)는 해리되어 생성물을 방출한다.<ref name = "Stryer_2002"/>

효소는 두 개 이상의 반응들을 짝지을 수 있으므로 열역학적으로 유리한 반응을 이용하여 열역학적으로 불리한 반응을 진행시켜서 생성물의 결합된 에너지를 기질보다 낮출 수 있다. 예를 들어, [[아데노신 삼인산|ATP]]의 가수분해는 종종 다른 화학 반응을 일으키는데 사용된다.<ref name="Nicholls">{{서적 인용|vauthors=Ferguson SJ, Nicholls D, Ferguson S | title = Bioenergetics 3 |url=https://archive.org/details/bioenergetics30000nich | publisher = Academic | location = San Diego | year = 2002 | isbn = 0-12-518121-3 | edition = 3rd}}</ref>

== 효소의 활성화 에너지 ==
{{본문|활성화 에너지}}
=== 엔트로피와 깁스 자유 에너지 ===
[[엔트로피]]란 화학 반응계에서 구성 성분들의 무질서도를 나타내는 것이다. 화학 반응계에서는 이런 엔트로피의 변화를 ΔS로 표시한다. 무작위성이 증가될 때는 ΔS가 양의 값이 되고, 무작위성이 감소할 때는 ΔS가 음의 값이 된다.<ref name="Freeman">David L. Nelson, Michael M. Cox. , 《Lehninger principles of biochemistry 4th》, New York : W. H. Freeman, 2005, 23~24</ref>

일에 실제로 이용할 수 있는 에너지를 [[깁스 자유 에너지|자유 에너지]]라고 한다. [[조사이어 윌러드 기브스|깁스]]는 화학 반응에서 이러한 [[에너지]] 변화와 관련된 이론을 제시했다. 닫힌 반응계에서 [[화학 반응]]은 [[화학 평형|평형]]이 될 때까지 자발적으로 진행한다. 이런 상황에서 일정한 온도, 압력에서 반응계가 초기상태에서 평형상태로 변화됨에 따른 에너지 변화가 자유 에너지 변화가 된다.<ref name="Freeman"/>

그것을 식으로 나타낸 것이 G=H-TS이다. G는 자유 에너지를 나타내는 것이며, 이 자유 에너지의 양은 엔탈피(H), 엔트로피(S), 절대온도(T)를 통해 결정된다. 즉, 어떤 화학 반응이 일정한 온도에서 일어날 때, 자유 에너지의 변화는 ΔH(붕괴되거나 형성되는 화학결합과 비공유결합성 상호작용의 종류와 수에 의해 결정됨)와 무작위성의 변화인 ΔS에 의하여 결정되는 것이다(ΔG = ΔH - TΔS).<ref name="Freeman" />

ΔG의 크기는 특별한 화학 반응이나 반응계가 초기의 평형으로부터 얼마나 멀어져 있는가에 의존한다. 화학 반응에 관계되는 각각의 화합물은 결합의 종류와 수에 관계되는 일정량의 [[위치 에너지]]를 가지고 있다. 자유 에너지의 감소 반응은 자발적으로 일어나는 반응으로, 생성물은 기질보다 더 적은 자유 에너지를 가지므로 반응이 일어남에 따라 자유 에너지를 방출하고 일을 할 수 있다. 이 때 방출된 에너지의 일부만이 일을 수행하는데 사용된다. 이와 다르게 자유 에너지의 증가 반응은 에너지를 흡수하는 반응이다.<ref name="Freeman"/>

생물학적으로 보았을 때 [[세포]]의 중요 기능을 수행하는 [[단백질]]과 같은 거대분자들의 형성에 필요한 자유 에너지는 양(+)의 값이다. 열역학적으로 불리한 반응, 바꾸어 말하면 에너지 요구 반응(자유 에너지의 증가 반응)을 수행하기 위하여 세포는 이 반응을 자유 에너지를 방출하는 다른 반응(자유 에너지의 감소 반응)과 짝지어 일어나게 함으로써, 전체 과정이 자유 에너지의 감소 반응으로 되고, 그 결과 자유 에너지 변화의 총합은 음(-)의 값이 된다. 이와 같이 자유 에너지의 감소 반응과 자유 에너지의 증가 반응이 짝지어지는 것은 생물의 반응계에서 에너지 교환에 절대적으로 중요하다.<ref name="Freeman"/>

=== 반응 속도 ===
{{본문|반응 속도}}
==== 반응 속도에 대한 정확한 열역학적 정의 ====
특정한 [[화학 반응]]의 속도는 [[반응물|기질]]의 농도와 속도상수(일반적으로 k로 표시함)에 의하여 결정된다. 기질(S)로부터 [[생성물]](P)로의 단일분자의 반응에서, [[반응 속도]](V)는 단위 시간당 반응하는 기질의 양을 의미하고 다음의 식으로 표시된다(V=k[S]).<ref name="Freeman1">David L. Nelson, Michael M. Cox. , 《Lehninger principles of biochemistry 4th》, New York : W. H. Freeman, 2005, 195~196</ref>

이 반응에서 반응 속도는 단지 기질의 농도에 의해서만 변한다는 것을 알 수 있다. 이와 같은 반응을 1차 반응이라 한다. 속도상수 k는 주어진 조건(PH, 온도 등)에서 반응의 확률을 나타내는 비례 상수이다. 여기에서 k는 1차 속도 상수가 되고 그 단위는 시간의 역수(s<sup>-1</sup>)가 된다.<ref name="Freeman1"/>

2차 반응이란 반응 속도가 서로 다른 2가지 화합물의 농도에 의해 결정되거나, 같은 화합물이라도 2개의 분자가 반응에 참여할 때를 의미한다. 이 때 k는 2차 속도 상수가 된다. 이 반응 속도식은 다음과 같이 나타낼 수 있다(V=k[S<sub>1</sub>][S<sub>2</sub>]).<ref name="Freeman1"/>

여기에 전이 상태 이론을 적용하면, 속도상수와 [[활성화 에너지]]가 관련되는 식이 유도된다.

k = kT/h<math>e^{-{\Delta G} \over {RT}}</math> (k는 볼츠만 상수, h는 플랑크 상수)<ref name="Freeman1"/>

이 식에서 중요한 것은 속도상수 k와 활성화 에너지 ΔG는 지수 함수적인 반비례의 관계에 있다는 것이다. 식에 따라 활성화 에너지가 낮으면 반응 속도는 증가하고, 활성화 에너지가 높으면 반응 속도는 감소하는 것을 알 수 있다.<ref name="Freeman1"/>

==== 효소의 활성화 에너지의 변화와 반응 속도의 관계 ====
화학 반응에서 반응의 시작점을 [[바닥 상태]]라고 부르는데, 이것은 주어진 조건에서 계에 의하여 주어지는 [[깁스 자유 에너지|자유 에너지]]이다. 기질의 바닥 상태에서 자유 에너지와 생성물의 바닥 상태에서 자유 에너지의 차이가 둘 사이의 평형을 결정한다.

기질과 생성물의 사이에는 에너지 장벽이 존재한다. 반응이 진행되기 위해서는 분자를 이 에너지 장벽보다 높은 에너지 상태까지 높여주어야 한다. 에너지가 제일 높은 지점에 분자가 위치한 것을 [[전이 상태]]라고 한다. 전이 상태는 결합의 파괴와 형성 그리고 전하의 변화라고 하는 것이, 기질에도 생성물에도 균등하게 진행될 수 있는 어떤 시점에 도달한 순간을 가리킨다.

[[바닥 상태]]와 [[전이 상태]]의 에너지의 차를 [[활성화 에너지]](ΔG)라고 부른다. [[반응 속도]]는 이 활성화 에너지에 의하여 좌우된다.

온도를 높여 주게 되면 반응 속도는 증가하는데, 이러한 상태는 에너지의 장벽을 넘어가는데 충분한 에너지를 가지고 있는 분자의 수가 많아지기 때문이다. 또한 활성화 에너지는 촉매를 가해 줌으로써 낮출 수 있다. 촉매는 반응의 활성화 에너지를 낮추어 줌으로써 반응 속도를 증가시킨다. 효소는 촉매의 일종인 생체촉매로서 반응 속도를 증가시킨다.<ref>상게서, 194~195</ref>

활성화 에너지는 세포가 계속해서 살아가는데 있어서 대단히 중요하다. 분자는 활성화 에너지가 높을수록 안정하며, 만일 이러한 에너지의 장벽이 없다면 복잡한 구조를 가지고 있는 생체 거대분자는 좀 더 단순한 분자의 형태로 자발적으로 변화되어 버릴 것이다. 또한 세포가 가지고 있는 복잡하면서도 고도의 질서를 유지하고 있는 구조나 [[대사 경로]]는 존재 할 수 없게 된다. 세포는 효소를 이용하여 살아가는데 필요한 반응에 대해 선택적으로 활성화 에너지를 낮출 수 있도록 진화되어 온 것이다.

=== 결합 에너지 ===
==== 결합 에너지와 그 작용기작 ====
효소가 특이적 반응에서 오는 [[활성화 에너지]]를 극도로 낮출 수 있는 이유는 [[결합 에너지]]에 있다. 활성화 에너지를 낮추는데 필요한 대부분의 에너지는 일반적으로 [[반응물|기질]]과 효소 사이의 약한 결합인 비공유결합들로부터 얻어진다.

효소는 특이적인 효소-기질 복합체(ES 복합체)를 형성한다는 점에서 많은 다른 촉매들과 구별된다. 이 효소-기질 복합체에서 기질과 효소의 결합 방식은 단백질 분자의 구조를 안정화시키는 요인인 [[수소 결합]], 소수성 결합, [[이온 결합]] 등에 의존한다. 이들 결합들은 효소-기질 복합체 내부에 약한 결합들을 형성함으로써 이러한 상호작용을 안정화시킬 정도의 적은 [[깁스 자유 에너지|자유 에너지]]가 방출된다. 이와 같은 효소-기질 상호작용에 의하여 얻어진 에너지를 결합 에너지라고 부른다. 이 결합 에너지의 의미는 단지 효소-기질간의 상호작용의 안정화에만 국한되지 않는다. 결합 에너지는 효소가 반응의 활성화 에너지를 낮추는 데 사용되는 자유 에너지의 중요한 공급원이다.<ref name="Freeman2">David L. Nelson, Michael M. Cox. , 《Lehninger principles of biochemistry 4th》, New York : W. H. Freeman, 2005, 196~199</ref>

[[파일:Induced fit diagram.svg|섬네일|600px|가운데|효소의 작용 과정]]

효소가 반응을 촉매하기 위해서는 반응의 [[전이 상태]]에서 기질과 상보적이 되어야만 한다. 다시 말하면 기질과 효소 간의 최적의 관계(약한 상호작용)는 전이 상태에서만 생길 수 있다. 일부의 약한 상호작용이 효소-기질 복합체에서 형성되며, 기질과 효소간의 약한 상호작용에 의한 완전히 상보적인 결합은 반응이 전이 상태가 되어서야 비로소 형성되는 것이다.

이 결합을 형성할 때에 방출되는 [[결합 에너지]]의 일부가 에너지 장벽을 뛰어넘는 데에 필요한 에너지의 일부로서 사용된다. 반응이 일어나기 어렵게 하는 활성화 에너지와 반응이 일어나기 쉽게 하는 결합 에너지의 차이가 알짜 활성화 에너지가 된다. 전이 상태는 기질이 에너지 장벽의 꼭대기에 있는 대단히 짧은 시간인데, 효소가 촉매하는 반응의 경우에 에너지 장벽의 높이가 아주 낮기 때문에 효소 반응은 비효소 반응보다 [[반응 속도]]가 훨씬 빠른 것이다.<ref name="Freeman2"/>

여기서 가장 중요한 효소 반응의 원리는 효소와 기질 간의 약한 결합이 효소 촉매 반응의 주요한 에너지원이 된다는 것이다. 이와 같은 반응에서 효소와 약한 상호작용에 관여하고 있는 기질의 부분은 절단 부위나 변화를 받는 부위와 다른 곳에 있다. 따라서 전이 상태에서 처음으로 형성되는 약한 상호작용이 촉매 반응의 진행에 가장 중요한 역할을 하게 된다.<ref name="Freeman2"/>

==== 결합 에너지의 효소 반응 메커니즘에 대한 역할 정리 ====
* [[결합 에너지]]는 촉매 반응에 필요한 에너지를 공급할 뿐 아니라 반응의 특이성을 확보하는 데에도 관련되어 있다. 기질 특이성이란 효소와 반응하고자 경쟁하는 두 가지의 유사한 기질을 식별할 수 있는 효소의 능력을 말한다. 즉, 이러한 기질 특이성은 효소와 그 기질 분자 간에 많은 부분 혹은 기질이 되는 거의 모든 부분의 구조적인 면에서 다수의 약한 결합이 형성되어 만들어지는 것이다.
* 기질이 효소에 결합함으로써 [[엔트로피]]가 감소한다. 결합 에너지는 기질이 반응하는데 필요한 적절한 배치를 유지하도록 해준다.
* 기질과 효소 사이에 약한 결합이 형성됨으로써 기질은 탈용매화된다.
* [[전이 상태]]에서 형성되는 약한 상호작용에 의한 결합 에너지는 전자의 재배치에 의한 뒤틀림을 이용하여 기질이 반응하는 것을 열역학적으로 보상한다.
* 기질과 효소 사이에 부분적으로 여러 개의 약한 상호작용이 새로이 형성되면서 효소의 입체 형태의 변화가 유도된다.<ref>상게서, 199</ref>

== 효소 반응속도론 ==
{{multiple image
 | direction= vertical
 | width  = 325
 | footer  =

 | image1  = Enzyme mechanism 2.svg
 | alt1   = Schematic reaction diagrams for uncatalzyed (Substrate to Product) and catalyzed (Enzyme + Substrate to Enzyme/Substrate complex to Enzyme + Product)
 | caption1 = 효소가 있을 때와 없을 때의 화학 반응의 기작. 효소(E)는 [[반응물|기질]](S)과 결합하여 [[생성물]](P)를 생성한다.

 | image2  = Michaelis Menten curve 2.svg
 | alt2   = A two dimensional plot of substrate concentration (x axis) vs. reaction rate (y axis). The shape of the curve is hyperbolic. The rate of the reaction is zero at zero concentration of substrate and the rate asymptotically reaches a maximum at high substrate concentration.
 | caption2 = 기질의 농도에 따른 초기 반응속도의 관계를 보여주는 그래프.
 }}

{{본문|효소 반응속도론}}
효소 반응속도론은 효소가 기질과 어떻게 결합하고 기질을 생성물로 전환시키는지에 대한 연구이다.<ref>{{서적 인용|title=Enzyme kinetics : principles and methods|last=Hans|first=Bisswanger|isbn=9783527806461|edition= Third, enlarged and improved |location=Weinheim, Germany|oclc=992976641}}</ref> 효소 반응 속도론에 사용되는 속도 데이터는 일반적으로 [[효소 분석법]]에서 얻는다. 1913년에 [[레오노르 미하엘리스]]와 [[모드 레오노라 멘텐]]은 [[미하엘리스-멘텐 속도론]]이라 불리는 효소 반응 속도론의 정량적인 이론을 제안했다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Michaelis L, Menten M | year = 1913 | title = Die Kinetik der Invertinwirkung | journal = Biochem. Z. | volume = 49 | pages = 333–369 | language = German | trans-title = The Kinetics of Invertase Action }}; {{저널 인용| vauthors = Michaelis L, Menten ML, Johnson KA, Goody RS | title = The original Michaelis constant: translation of the 1913 Michaelis-Menten paper | journal = Biochemistry | volume = 50 | issue = 39 | pages = 8264–9 | year = 2011 | pmid = 21888353 | pmc = 3381512 | doi = 10.1021/bi201284u }}</ref> 미하엘리스와 멘텐의 주요 공헌은 효소 반응이 두 단계로 나뉘어 일어난다고 생각한 것이었다. 첫째, 기질은 효소와 가역적으로 결합하여 효소-기질 복합체를 형성한다. 효소-기질 복합체는 미하엘리스와 멘텐의 업적을 기리기 위해 때때로 미하엘리스-멘텐 복합체로도 불린다. 둘째, 효소는 반응에서 화학 반응을 촉매한 다음, 생성물을 방출한다. 효소 반응 속도론에 대한 연구는 [[조지 에드워드 브릭스]]와 [[존 버든 샌더슨 홀데인]]에 의해 더욱 더 발전되었으며, 이들은 오늘날에도 여전히 널리 사용되고 있는 효소 반응 속도식을 도출해 냈다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Briggs GE, Haldane JB | title = A Note on the Kinetics of Enzyme Action | url = https://archive.org/details/sim_biochemical-journal_1925_19_2/page/n174 | journal = The Biochemical Journal | volume = 19 | issue = 2 | pages = 338–9 | year = 1925 | pmid = 16743508 | pmc = 1259181 | doi=10.1042/bj0190338}}</ref>

효소가 촉매하는 반응 속도는 [[용액]]의 조건과 기질의 [[농도]]에 달려있다. 효소 반응의 최대 속도를 찾기 위해 생성물이 일정한 속도로 생성될 때까지 기질의 농도를 증가시킨다. 이것은 오른쪽의 포화 곡선에 나타나 있다. 포화는 기질의 농도가 증가함에 따라 유리 효소가 보다 더 많이 효소-기질 복합체로 전환되기 때문에 일어난다. 효소의 최대 반응 속도(V<sub>max</sub>)에서 모든 효소의 활성 부위는 기질과 결합하고, 효소-기질 복합체의 총 개수는 효소의 총 개수와 같다.<ref name = "Stryer_2002"/>

V<sub>max</sub>는 몇 가지 효소 반응 속도론의 중요한 매개 변수 중 하나이다. 주어진 반응 속도를 달성하기 위해 필요한 기질의 양도 또한 중요하다. 이는 효소가 최대 반응 속도의 1/2에 도달하기 위해 필요한 기질의 농도인 [[미하엘리스-멘텐 속도론|미하엘리스-멘텐 상수]](K<sub>m</sub>)에 의해 주어진다. 일반적으로, 각각의 효소는 주어진 기질에 대한 고유한 K<sub>m</sub>을 가지고 있다. 또 다른 유용한 상수는 전환수(turnover number)라고도 하는 k<sub>cat</sub>이며, k<sub>cat</sub>은 효소가 기질로 포화되었을 때 단위 시간당 1개의 효소 분자에 의해 생성물로 바뀌는 기질 분자의 수를 의미한다.<ref name = "Stryer_2002"/>

효소의 효율은 k<sub>cat</sub>/K<sub>m</sub>으로 나타낼 수 있다. k<sub>cat</sub>/K<sub>m</sub>은 특이성 상수라고도 하며, k<sub>cat</sub>/K<sub>m</sub>은 E+S가 E+P로 전환하는 [[속도 상수]]로 첫 번째 비가역적인 단계를 포함한 반응의 모든 단계에 대한 속도 상수를 포함한다. 특이성 상수는 친화도 및 촉매 능력을 모두 반영하기 때문에 서로 다른 효소들을 비교하거나 서로 다른 기질을 사용하는 동일한 효소를 서로 비교하는데 유용하다. 특이성 상수에 대한 이론적 최대값을 확산 한계(diffusion limit)라고 하며, 약 10<sup>8</sup>~10<sup>9</sup> M<sup>−1</sup> s<sup>−1</sup>이다. 이때 효소는 기질과 충돌할 때마다 촉매 작용이 일어나며, 생성물의 형성 속도는 반응 속도에 의해서가 아니라 확산 속도에 의해 제한된다. 이러한 특성을 가지고 있는 효소는 촉매적으로 완벽하거나 반응속도론적으로 완벽(확산 지배 효소)하다고 불린다. 확산 지배 효소의 예로는 [[삼탄당 인산 이성질화효소]], [[탄산무수화효소]], [[아세틸콜린에스터레이스]], [[카탈레이스]], [[푸마레이스]], [[β-락타메이스]], [[초과산화물 불균등화효소]] 등이 있다.<ref name = "Stryer_2002"/> 이러한 효소들의 전환율은 초당 수백만 회의 반응에 이를 수 있다.<ref name = "Stryer_2002"/> 그러나 대부분의 효소들은 촉매적으로 완벽한 상태와는 거리가 멀다. 일반적인 효소들의 <math>k_{\rm cat}/K_{\rm m}</math>의 평균값은 약 <math> 10^5 {\rm s}^{-1}{\rm M}^{-1}</math>이고, <math>k_{\rm cat}</math>의 평균값은 약 <math>10 {\rm s}^{-1}</math>이다.<ref name="Bar-Even_2011">{{저널 인용| vauthors = Bar-Even A, Noor E, Savir Y, Liebermeister W, Davidi D, Tawfik DS, Milo R | title = The moderately efficient enzyme: evolutionary and physicochemical trends shaping enzyme parameters | journal = Biochemistry | volume = 50 | issue = 21 | pages = 4402–10 | year = 2011 | pmid = 21506553 | doi = 10.1021/bi2002289 }}</ref>

미하엘리스-멘텐 반응 속도론은 자유 [[확산]] 및 열역학적으로 유도되는 무작위적 충돌의 가정으로부터 도출된 [[질량작용의 법칙]]에 달려있다. 많은 생화학적 또는 세포적 과정들은 [[고분자 군집]] 및 제한된 분자 운동으로 인해 이러한 조건들에서 크게 벗어난다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Ellis RJ | title = Macromolecular crowding: obvious but underappreciated | journal = Trends in Biochemical Sciences | volume = 26 | issue = 10 | pages = 597–604 | date = October 2001 | pmid = 11590012 | doi = 10.1016/S0968-0004(01)01938-7 }}</ref> 보다 최근의, 복잡한 모델의 확장은 이러한 효과들의 수정을 시도하고 있다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Kopelman R | title = Fractal reaction kinetics | journal = Science | volume = 241 | issue = 4873 | pages = 1620–26 | date = September 1988 | pmid = 17820893 | doi = 10.1126/science.241.4873.1620 | bibcode = 1988Sci...241.1620K }}</ref>

== 저해 ==
 {{multiple image
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 | image1  = DHFR methotrexate inhibitor.svg
 | alt1   = 
 | caption1 = 기질이 결합하는 결합 부위에 [[경쟁적 저해제]]가 결합해 있으면 기질의 결합을 방해할 수 있다. [[메토트렉세이트]]는 [[다이하이드로폴산 환원효소]]의 경쟁적 저해제로 기질인 [[폴산]]의 결합을 방해한다.<ref name="Goodsell 340–341">{{저널 인용|last=Goodsell|first=David S.|date=1999-08-01|title=The Molecular Perspective: Methotrexate|url=http://theoncologist.alphamedpress.org/content/4/4/340|journal=The Oncologist|language=en|volume=4|issue=4|pages=340–341|issn=1083-7159|pmid=10476546|access-date=2019-09-19|archive-date=2019-03-22|archive-url=https://web.archive.org/web/20190322224341/http://theoncologist.alphamedpress.org/content/4/4/340|url-status=}}</ref> 결합 부위는 파란색, 저해제는 녹색, 기질은 검은색으로 표시되어 있다. ({{PDB|4QI9}})

 | image2  = Methotrexate vs folate 2.svg
 | alt2   = Two dimensional representations of the chemical structure of folic acid and methotrexate highlighting the differences between these two substances (amidation of pyrimidone and methylation of secondary amine).
 | caption2 = 조효소인 [[폴산]](왼쪽)과 항암제인 [[메토트렉세이트]](오른쪽)은 구조가 매우 비슷하다(차이점은 녹색으로 표시함). 따라서 메토트렉세이트는 폴산을 사용하는 많은 효소들의 경쟁적 저해제로 작용한다.
 }}

{{본문|효소 저해제}}
효소 반응 속도는 다양한 유형의 [[효소 저해제]]에 의해 감소될 수 있다.<ref name = "Cornish-Bowden_2004">{{서적 인용| author = Cornish-Bowden A | title = Fundamentals of Enzyme Kinetics | date = 2004 | publisher = Portland Press | location = London | isbn = 1-85578-158-1 | edition = 3 }}</ref>

=== 저해의 유형 ===
==== 가역적 저해 ====
[[가역적 저해제]] (reversible inhibitor)는 오직 효소와 일시적인 결합체만을 형성한다. 용어 자체가 암시하듯이 가역적 저해제는 효소와 저해제간의 평형이 성립되고 효소에 대한 저해제의 친화력은 평형 또는 해리상수로 표시된다. 최근에는 3가지 유형의 가역적 저해제가 알려져 있는데 경쟁적 저해제, 비경쟁적 저해제, 무경쟁적 저해제가 그 예이다.

===== 경쟁적 저해 =====
[[경쟁적 저해제]] (competitive inhibitor)는 구조가 기질과 유사해서 기질과 경쟁적으로 효소의 활성 부위에 결합한다.<ref name = "Price_1979">{{저널 인용| vauthors = Price NC | year = 1979 | title = What is meant by 'competitive inhibition'? | journal = Trends in Biochemical Sciences | volume = 4 | issue=11 | pages = N272–N273 | doi = 10.1016/0968-0004(79)90205-6 }}</ref> 경쟁적 저해제가 효소의 활성 부위에 결합하면 기질이 효소에 결합하지 못하므로 반응이 저해되어 반응 속도가 감소한다. 예를 들어, [[메토트렉세이트]]라는 약물은 다이하이드로폴산을 테트라하이드로폴산으로의 환원을 촉매하는 효소인 [[다이하이드로폴산 환원효소]]의 경쟁적 저해제이다.<ref name="Goodsell 340–341">{{저널 인용|last=Goodsell|first=David S.|date=1999-08-01|title=The Molecular Perspective: Methotrexate|url=http://theoncologist.alphamedpress.org/content/4/4/340|journal=The Oncologist|language=en|volume=4|issue=4|pages=340–341|issn=1083-7159|pmid=10476546|access-date=2019-09-19|archive-date=2019-03-22|archive-url=https://web.archive.org/web/20190322224341/http://theoncologist.alphamedpress.org/content/4/4/340|url-status=}}</ref> 다이하이드로폴산과 메토트렉세이트의 구조적 유사성은 오른쪽 그림에 표시되어 있다. 기질의 농도가 증가하면 경쟁적 저해제의 저해 효과가 감소한다. 다른 경우에, 저해제는 통상적인 기질의 결합 부위가 아닌 다른 부위에 결합해서 [[다른 자리 입체성 조절]] 효과를 발휘하여 통상적인 결합 부위의 형태를 변화시킬 수 있다.<ref>{{저널 인용|date=2015-12-01|title=Allosteric small-molecule kinase inhibitors|url=http://orbit.dtu.dk/ws/files/129911346/PT_Revised_Main_Manuscript_with_embedded_figures.pdf|journal=Pharmacology & Therapeutics|language=en|volume=156|pages=59–68|doi=10.1016/j.pharmthera.2015.10.002|issn=0163-7258|last1=Wu|first1=Peng|last2=Clausen|first2=Mads H.|last3=Nielsen|first3=Thomas E.}}</ref>

===== 무경쟁적 저해 =====
[[무경쟁적 저해제]] (non-competitive inhibitor) 또는 [[비경쟁적 저해제]]는 효소의 활성 부위가 아닌 다른 부위에 결합한다. 비경쟁적 저해제가 효소에 결합하면 효소의 활성 부위의 입체 구조가 변해 기질이 효소에 결합하지 못하므로 반응이 저해되어 반응 속도가 감소한다. 기질은 여전히 평소의 친화력으로 효소와 결합하므로 K<sub>m</sub>은 동일하게 유지된다. 그러나 비경쟁적 저해제는 효소의 촉매 효율을 감소시키기 때문에 V<sub>max</sub>는 감소한다. 경쟁적 저해제와는 달리, 비경쟁적 저해제는 기질의 농도가 증가해도 저해 효과가 감소하지 않는다.<ref name = "Cornish-Bowden_2004"/>

===== 반경쟁적 저해 =====
[[반경쟁적 저해제]] (uncompetitive inhibitor) 또는 [[불경쟁적 저해제]] 또는 [[비경쟁적 저해제]] 또는 [[무경쟁적 저해제]]는 유리 효소에 결합할 수 없고, 효소 기질 복합체에만 결합할 수 있다. 따라서 무경쟁적 저해제는 기질의 농도가 높을 때 가장 효과적이다. 무경쟁적 저해제의 존재 하에서 효소-기질 복합체는 활성화되지 않는다.<ref name = "Cornish-Bowden_2004"/> 무경쟁적 저해는 매우 드문 효소 저해 유형이다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Cornish-Bowden A | title = Why is uncompetitive inhibition so rare? A possible explanation, with implications for the design of drugs and pesticides | journal = FEBS Letters | volume = 203 | issue = 1 | pages = 3–6 | date = July 1986 | pmid = 3720956 | doi=10.1016/0014-5793(86)81424-7}}</ref>

===== 혼합 저해 =====
[[혼합 저해제]] (mixed inhibitor)는 다른 자리 입체성 부위에 결합하고, 효소 또는 효소-기질 복합체와 결합할 수 있다. 혼합적 저해제가 효소와 결합하고 있으면 효소의 기능이 떨어지지만, 효소의 기능이 없어지지는 않는다. 혼합적 저해제는 [[미하엘리스-멘텐 식]]을 따르지 않는다.<ref name = "Cornish-Bowden_2004"/>

==== 비가역적 저해 ====
[[비가역적 저해제]] (irreversible inhibitor)는 대개 단백질과 [[공유 결합]]을 형성하여 효소를 영구적으로 불활성화시킨다.<ref>{{저널 인용|last=Strelow|first=John M.|date=2017-01-01|title=A Perspective on the Kinetics of Covalent and Irreversible Inhibition|journal=SLAS DISCOVERY: Advancing Life Sciences R&D|language=en|volume=22|issue=1|pages=3–20|doi=10.1177/1087057116671509|pmid=27703080|issn=2472-5552}}</ref> [[페니실린]]<ref>{{저널 인용| vauthors = Fisher JF, Meroueh SO, Mobashery S | title = Bacterial resistance to beta-lactam antibiotics: compelling opportunism, compelling opportunity | journal = Chemical Reviews | volume = 105 | issue = 2 | pages = 395–424 | date = February 2005 | pmid = 15700950 | doi = 10.1021/cr030102i }}</ref>과 [[아스피린]]<ref name="Johnson">{{저널 인용| vauthors = Johnson DS, Weerapana E, Cravatt BF | title = Strategies for discovering and derisking covalent, irreversible enzyme inhibitors | journal = Future Medicinal Chemistry | volume = 2 | issue = 6 | pages = 949–64 | date = June 2010 | pmid = 20640225 | pmc = 2904065 | doi=10.4155/fmc.10.21}}</ref>은 이러한 방식으로 작용하는 흔한 [[약물]]들이다.

=== 저해제의 기능 ===
많은 생물에서 저해제는 [[피드백]] 메커니즘의 일부로 작용할 수 있다. 효소가 생물에서 특정 물질을 너무 많이 생성시키면, 그 물질은 물질을 생성하는 대사 경로의 시작 단계를 촉매하는 효소의 저해제로 작용하여 특정 물질의 양이 충분할 경우에 그 물질의 생성을 늦추거나 중단시킬 수 있다. 이것은 [[음성 피드백]]의 한 형태이다. [[시트르산 회로]]와 같은 주요 대사 경로들은 이러한 메커니즘을 사용한다.<ref name = "Stryer_2002" />

저해제는 효소의 기능을 조절할 수 있기 때문에 종종 약물로 사용된다. 그러한 많은 약물들은 [[메토트렉세이트]]와 같이 효소의 고유 기질과 비슷한 구조를 가지고 있는 가역적인 경쟁적 저해제이다. 경쟁적 저해제의 또 다른 잘 알려진 예로는 [[콜레스테롤]]의 수치가 높은 환자들의 치료에 사용되는 [[스타틴]]<ref name="Endo1992">{{저널 인용 | author = Endo A | title = The discovery and development of HMG-CoA reductase inhibitors | journal = J. Lipid Res. | volume = 33 | issue = 11 | pages = 1569–82 | date = 1 November 1992 | pmid = 1464741 | url = http://www.jlr.org/cgi/reprint/33/11/1569 | format = PDF | access-date = 2019-09-19 | archive-date = 2010-02-14 | archive-url = https://web.archive.org/web/20100214051502/http://www.jlr.org/cgi/reprint/33/11/1569 }}</ref> 및 [[HIV]]와 같은 [[레트로바이러스]]에 감염된 환자들의 치료에 사용되는 [[프로테이스 저해제]] 등이 있다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Wlodawer A, Vondrasek J | title = Inhibitors of HIV-1 protease: a major success of structure-assisted drug design | journal = Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure | volume = 27 | pages = 249–84 | date = 1998 | pmid = 9646869 | doi = 10.1146/annurev.biophys.27.1.249 }}</ref> 약물로 사용되는 비가역적 저해제의 예로는 [[염증]] 반응을 조절하는 [[프로스타글란딘]]을 생성하는 효소인 [[사이클로옥시제네이스|사이클로옥시제네이스-1]](COX-1)과 [[사이클로옥시제네이스|사이클로옥시제네이스-2]](COX-2)를 저해하는 [[아스피린]]이 있다.<ref name="Johnson" /> 다른 효소 저해제들 중에는 독으로 작용하는 것도 있다. 예를 들어, [[사이안화물]] 독은 [[사이토크롬 c 산화효소]]의 활성 부위에 있는 구리 및 철과 결합하여 [[세포 호흡]]을 차단하는 비가역적 효소 저해제이다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Yoshikawa S, Caughey WS | title = Infrared evidence of cyanide binding to iron and copper sites in bovine heart cytochrome c oxidase. Implications regarding oxygen reduction | journal = The Journal of Biological Chemistry | volume = 265 | issue = 14 | pages = 7945–58 | date = May 1990 | pmid = 2159465 }}</ref>

== 생물학적 기능 ==
효소는 살아있는 생물체 내에서 다양한 [[기능 (생물학)|기능]]을 한다. 효소는 [[신호 전달]]과 세포 조절에 필수적이며 종종 [[키네이스]] 및 [[포스파테이스]]를 통해 관여한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Hunter T | title = Protein kinases and phosphatases: the yin and yang of protein phosphorylation and signaling | journal = Cell | volume = 80 | issue = 2 | pages = 225–36 | date = January 1995 | pmid = 7834742 | doi = 10.1016/0092-8674(95)90405-0 }}</ref> 또한 효소는 [[근수축]]을 위해 [[아데노신 삼인산|ATP]]를 가수분해한 에너지를 이용하여 [[마이오신]]의 움직임을 발생시키며, [[세포 골격]]의 일부로서 세포 주위로 물질을 운반한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Berg JS, Powell BC, Cheney RE | title = A millennial myosin census | journal = Molecular Biology of the Cell | volume = 12 | issue = 4 | pages = 780–94 | date = April 2001 | pmid = 11294886 | pmc = 32266 | doi = 10.1091/mbc.12.4.780 }}</ref> 세포막에 있는 다른 ATPase는 [[능동수송]]에 관여하는 [[이온 펌프]]이다. 또한 효소는 [[반딧불이과|반딧불이]]의 빛을 생성하는 [[루시퍼레이스]]와 같은 보다 색다른 기능에도 관여한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Meighen EA | title = Molecular biology of bacterial bioluminescence | journal = Microbiological Reviews | volume = 55 | issue = 1 | pages = 123–42 | date = March 1991 | pmid = 2030669 | pmc = 372803 }}</ref> 바이러스는 또한 [[HIV 인테그레이스]] 및 [[역전사효소]]와 같이 세포를 감염시키기 위해 필요한 효소나 [[인플루엔자]] 바이러스의 [[뉴라미니데이스]]와 같이 세포로부터 바이러스를 방출시키는데 필요한 효소를 함유할 수 있다.<ref name="pmid12370077">{{저널 인용| vauthors = De Clercq E | title = Highlights in the development of new antiviral agents | journal = Mini Rev Med Chem | volume = 2 | issue = 2 | pages = 163–75 | year = 2002 | pmid = 12370077 | doi = 10.2174/1389557024605474 }}</ref>

효소의 중요한 기능 중 하나는 동물의 [[소화계]]에서 소화 효소로 작용하는 것이다. [[아밀레이스]]나 [[프로테이스]]와 같은 효소는 큰 분자([[녹말]]이나 [[단백질]])를 작은 분자로 분해하여 소장에서 흡수될 수 있도록 돕는다. 예를 들어, 녹말 분자는 너무 커서 소장에서 흡수되지 않지만, 효소는 녹말 사슬을 [[엿당]]과 같이 더 작은 분자로 가수분해한 다음 결국 [[포도당]]으로 가수분해하여 흡수할 수 있도록 한다. [[반추동물]]은 장에 공생하는 미생물이 분비하는 [[셀룰레이스]] 덕분에 식물 세포벽의 성분인 [[셀룰로스]]를 분해할 수 있다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Mackie RI, White BA | title = Recent advances in rumen microbial ecology and metabolism: potential impact on nutrient output | journal = Journal of Dairy Science | volume = 73 | issue = 10 | pages = 2971–95 | date = October 1990 | pmid = 2178174 | doi = 10.3168/jds.S0022-0302(90)78986-2 }}</ref>

=== 물질대사 ===
[[파일:Glycolysis metabolic pathway.svg|섬네일|400px|alt=Schematic diagram of the glycolytic metabolic pathway starting with glucose and ending with pyruvate via several intermediate chemicals. Each step in the pathway is catalyzed by a unique enzyme.|[[해당과정]]의 [[대사 경로]]는 [[포도당]]을 일련의 [[대사 중간생성물]]들을 거쳐 [[피루브산]]으로 전환하는 것으로, 전체적으로 에너지를 방출하는 과정이다. 각각의 단계는 서로 다른 효소들에 의해 수행된다.]]

여러 효소들이 특정 순서로 함께 작용해서 [[대사 경로]]를 형성한다.<ref name = "Stryer_2002" /> 대사 경로에서 어떤 효소는 다른 효소의 생성물을 기질로 사용한다. 촉매 반응 후에 생성물은 다른 효소로 옮겨진다. 때로는 한 가지 이상의 효소가 동일한 반응을 동시에 촉매할 수 있는데, 이는 보다 복잡한 조절을 가능하게 한다. 예를 들어, 하나의 효소에 의해서는 일정한 수준의 낮은 활성을 가지지만, 두 번째 효소로부터 높은 활성이 유도될 수 있다.<ref name="Rouzer_2009">{{저널 인용| vauthors = Rouzer CA, Marnett LJ | title = Cyclooxygenases: structural and functional insights | journal = J. Lipid Res. | volume = 50 Suppl | issue = | pages = S29–34 | year = 2009 | pmid = 18952571 | pmc = 2674713 | doi = 10.1194/jlr.R800042-JLR200 }}</ref>

효소는 대사 경로에서 어떤 단계를 일어나게 할지를 결정한다. 효소가 없다면 물질대사는 일어나지 않을 것이고, 세포의 필요를 충족시키기 위해 대사를 조절할 수도 없을 것이다. 대부분의 중심 대사 경로들은 주로 [[아데노신 삼인산|ATP]]의 가수분해 활성을 가지고 있는 효소들을 통해 몇 가지 핵심적인 단계에서 조절된다. ATP의 가수분해 반응은 많은 에너지를 방출하기 때문에 열역학적으로 불리한 반응을 ATP 가수분해와 짝지어서 일련의 연결된 대사 반응들을 일으킬 수 있다.<ref name = "Stryer_2002" />

=== 효소 활성의 통제 ===
세포 내에서 효소의 활성을 통제하는 5가지 주요 방식이 있다.<ref name = "Stryer_2002" />

==== 조절 ====
효소는 다른 분자들에 의해서 활성화되거나 저해될 수 있다. 예를 들어, 대사 경로의 최종 생성물은 종종 대사 경로의 첫 번째 효소(일반적으로 첫 번째 비가역적 단계 또는 개입 단계라고 함)에 대한 저해제이며, 따라서 대사 경로에 의해 만들어지는 최종 생성물의 양을 조절한다. 이러한 조절 메커니즘은 생성된 최종 생성물의 양이 최종 생성물의 농도에 의해 조절되기 때문에 [[음성 피드백]] 조절 메커니즘이라고 불린다.<ref name = "Suzuki_2015_8"/> 음성 피드백 조절 메커니즘은 세포의 요구에 따른 대사 중간생성물의 합성 속도를 효과적으로 조절할 수 있다. 이러한 음성 피드백 조절은 물질 및 에너지의 효과적인 배분에 도움을 주며, 최종 생성물의 과도한 생성을 방지한다. 다른 [[항상성]] 조절 기작과 마찬가지로, 효소 작용의 조절은 살아있는 생물체에서 안정적인 내부 환경을 유지하는데 도움을 준다.<ref name = "Suzuki_2015_8"/>

==== 번역 후 변형 ====
[[번역 후 변형]]의 예로는 [[인산화]], [[미리스토일화]], [[글리코실화]] 등이 있다.<ref name = "Suzuki_2015_8">{{서적 인용| author = Suzuki H | title = How Enzymes Work: From Structure to Function | publisher = CRC Press | location = Boca Raton, FL | year = 2015 | isbn = 978-981-4463-92-8 | chapter = Chapter 8: Control of Enzyme Activity | pages = 141–69 }}</ref> 예를 들어, [[인슐린]]에 대한 반응에서 [[글리코젠 생성효소]]를 비롯한 여러 효소들의 [[인산화]]는 [[글리코젠]]의 합성 또는 분해를 조절하고, 세포가 [[혈당]]의 변화에 반응하도록 한다.<ref name = "Doble_2003">{{저널 인용| vauthors = Doble BW, Woodgett JR | title = GSK-3: tricks of the trade for a multi-tasking kinase | journal = Journal of Cell Science | volume = 116 | issue = Pt 7 | pages = 1175–86 | date = April 2003 | pmid = 12615961 | pmc = 3006448 | doi = 10.1242/jcs.00384 }}</ref> 번역 후 변형의 또 다른 예는 [[폴리펩타이드]] 사슬의 절단이다. [[프로테이스]]인 [[키모트립신]]은 [[이자 (해부학)|이자]]에서 비활성형인 [[키모트립시노젠]]으로 생성되어 [[위 (해부학)|위]]로 운반된 다음 위에서 활성화된다. 이것은 장에서 분비되기 전에 효소가 이자나 다른 조직을 소화시키는 것을 막는다. 이러한 유형의 비활성 효소 전구체는 [[지모젠]]<ref name = "Suzuki_2015_8"/> 또는 프로효소로 알려져 있다.

==== 양 ====
효소의 생성(효소 [[유전자]]의 [[전사 (생물학)|전사]] 및 [[번역 (생물학)|번역]])은 세포 환경의 변화에 반응하여 세포에 의해 증가되거나 감소될 수 있다. 이러한 형태의 [[유전자 발현의 조절]]을 [[효소 유도인자|효소 유도]]라고 한다. 예를 들어, 세균은 [[페니실린]]과 같은 [[항생제 내성|항생제에 내성]]을 가질 수 있는데, 이는 페니실린 분자 내에서 중요한 [[베타-락탐 고리]]를 가수분해하는 [[베타-락타메이스]]라고 불리는 효소가 유도되기 때문이다.<ref name="pmid8452343">{{저널 인용| vauthors = Bennett PM, Chopra I | title = Molecular basis of beta-lactamase induction in bacteria | journal = Antimicrob. Agents Chemother. | volume = 37 | issue = 2 | pages = 153–8 | year = 1993 | pmid = 8452343 | pmc = 187630 | doi = 10.1128/aac.37.2.153}}</ref> 또 다른 예로는 [[간]]에 존재하는 [[사이토크롬 P450 산화효소]]가 있는데, 사이토크롬 P450 산화효소는 [[약물 대사]]에서 중요하다. 이러한 효소의 유도 또는 저해는 [[약물 상호작용]]을 일으킬 수 있다.<ref name = "Skett_Gibson_2001">{{서적 인용|vauthors=Skett P, Gibson GG | title = Introduction to Drug Metabolism |url=https://archive.org/details/introductiontodr0000gibs_w0z0 | date = 2001 | publisher = Nelson Thornes Publishers | location = Cheltenham, UK | isbn = 978-0748760114 | pages = [https://archive.org/details/introductiontodr0000gibs_w0z0/page/n96 87]–118 | edition = 3 | chapter = Chapter 3: Induction and Inhibition of Drug Metabolism }}</ref> 또한 효소의 양은 효소의 [[이화작용|분해]] 속도를 변화시킴으로써 조절할 수 있다.<ref name="Stryer_2002" /> [[효소 유도인자|효소 유도]]의 반대는 [[효소 억제인자|효소 억제]]이다.

==== 세포 내 분포 ====
효소는 구획화될 수 있으며, 서로 다른 [[세포 내 구획]]에서 서로 다른 대사 경로가 일어날 수 있다. 예를 들어, [[지방산]]은 [[세포질]], [[소포체]], [[골지체]]의 효소들에 의해 합성되고, [[미토콘드리아]]의 효소들에 의해 [[베타 산화]]되어 에너지원으로 사용된다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Faergeman NJ, Knudsen J | title = Role of long-chain fatty acyl-CoA esters in the regulation of metabolism and in cell signalling | journal = The Biochemical Journal | volume = 323 | issue = Pt 1 | pages = 1–12 | date = April 1997 | pmid = 9173866 | pmc = 1218279 | doi = 10.1042/bj3230001 }}</ref> 또한, 상이한 구획에 효소가 집중되는 것은 효소의 활성에 영향을 미치는 [[양성자화]](예: 중성의 [[세포질]] 및 산성의 [[리소좀]]) 또는 산화 상태(예: 산화된 [[주변세포질]] 또는 환원된 [[세포질]])의 정도를 변화시킬 수 있다.<ref name = "Suzuki_2015_4">{{서적 인용| author = Suzuki H | title = How Enzymes Work: From Structure to Function | publisher = CRC Press | location = Boca Raton, FL | year = 2015 | isbn = 978-981-4463-92-8 | chapter = Chapter 4: Effect of pH, Temperature, and High Pressure on Enzymatic Activity | pages = 53–74 }}</ref> 효소가 막에 결합된 [[세포소기관]]으로 구획화되는 것과는 달리, 효소의 세포 내 구획화는 효소의 중합을 통한 세포질의 거대분자 필라멘트로 변화될 수 있다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Noree C, Sato BK, Broyer RM, Wilhelm JE | title = Identification of novel filament-forming proteins in Saccharomyces cerevisiae and Drosophila melanogaster | journal = The Journal of Cell Biology | volume = 190 | issue = 4 | pages = 541–51 | date = August 2010 | pmid = 20713603 | pmc = 2928026 | doi = 10.1083/jcb.201003001 }}</ref><ref>{{저널 인용| vauthors = Aughey GN, Liu JL | title = Metabolic regulation via enzyme filamentation | journal = Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology | volume = 51 | issue = 4 | pages = 282–93 | date = 2015 | pmid = 27098510 | pmc = 4915340 | doi = 10.3109/10409238.2016.1172555 }}</ref>

==== 기관의 전문화 ====
[[다세포 생물|다세포]] [[진핵생물]]에서 여러 [[기관 (해부학)|기관]]과 [[조직 (생물학)|조직]]의 세포들은 [[유전자 발현]]의 패턴이 다르므로 대사 반응에 사용할 수 있는 효소들([[동질효소]]로 알려짐)의 세트가 다르다. 이것은 생물체의 전체적인 물질대사를 조절하는 기작을 제공한다. 예를 들어, [[해당과정]]의 첫 번째 단계를 촉매하는 효소인 [[헥소키네이스]]는 [[간]]과 [[이자 (해부학)|이자]]에서 발현되는 글루코키네이스라고 불리는 특수한 형태를 가지는데, [[글루코키네이스]]는 글루코스에 대한 친화도는 낮지만 글루코스 농도 변화에 보다 민감하게 반응한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Kamata K, Mitsuya M, Nishimura T, Eiki J, Nagata Y | title = Structural basis for allosteric regulation of the monomeric allosteric enzyme human glucokinase | journal = Structure | volume = 12 | issue = 3 | pages = 429–38 | date = March 2004 | pmid = 15016359 | doi = 10.1016/j.str.2004.02.005 }}</ref> 글루코키네이스는 [[혈당량]]을 감지하고 [[인슐린]]의 생성을 조절하는데 관여한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Froguel P, Zouali H, Vionnet N, Velho G, Vaxillaire M, Sun F, Lesage S, Stoffel M, Takeda J, Passa P | title = Familial hyperglycemia due to mutations in glucokinase. Definition of a subtype of diabetes mellitus | journal = The New England Journal of Medicine | volume = 328 | issue = 10 | pages = 697–702 | date = March 1993 | pmid = 8433729 | doi = 10.1056/NEJM199303113281005 }}</ref>

=== 질병 관련 ===
[[파일:Phenylalanine hydroxylase mutations.svg|섬네일|400px|alt= Ribbon diagram of phenylalanine hydroxylase with bound cofactor, coenzyme and substrate|[[페닐알라닌 하이드록실화효소]]는 구조를 변형시키는 300가지 이상의 다른 돌연변이들을 통해 [[페닐케톤뇨증]]을 일으킨다. 기질인 [[페닐알라닌]]과 조효소인 [[테트라하이드로비오프테린]]은 검은색, 보조 인자인 [[철|Fe<sup>2+</sup>]]는 노란색으로 표시되어 있다. ({{PDB|1KW0}})]]

{{참고|유전 질환}}
효소 활성의 엄격한 조절은 [[항상성]]에 필수적이기 때문에, 핵심적인 효소의 이상(돌연변이, 과잉생산, 과소생산 또는 결실)은 [[유전 질환]]을 일으킬 수 있다. 인체에 존재하는 수천 가지의 효소들 중 한 개의 효소에 이상이 생겨도 치명적일 수 있다. 효소의 결핍으로 인한 치명적인 유전 질환의 예로는 [[헥소사미니데이스]]의 결핍으로 유발되는 [[테이-삭스병]]이 있다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Okada S, O'Brien JS | title = Tay–Sachs disease: generalized absence of a beta-D-N-acetylhexosaminidase component | journal = Science | volume = 165 | issue = 3894 | pages = 698–700 | date = August 1969 | pmid = 5793973 | doi=10.1126/science.165.3894.698| bibcode = 1969Sci...165..698O }}</ref><ref>{{웹 인용| title = Learning About Tay–Sachs Disease | url = http://www.genome.gov/10001220 | publisher = U.S. National Human Genome Research Institute | accessdate = 1 March 2015 }}</ref>

[[페닐케톤뇨증]]은 효소 결핍으로 인한 질환의 가장 대표적인 예이다. [[페닐알라닌]]의 분해의 첫 번째 단계를 촉매하는 효소인 [[페닐알라닌 하이드록실화효소]]의 단일 아미노산 돌연변이는 페닐알라닌 및 관련된 물질의 축적을 일으킨다. 일부 돌연변이는 효소의 활성 부위에서 일어나서 기질과의 직접적인 결합과 촉매 작용을 방해하지만, 많은 돌연변이들은 효소의 활성 부위에서 먼 곳에서 일어나며 단백질의 구조를 불안정하게 만들거나 정확한 올리고머화에 영향을 미쳐서 효소의 활성을 감소시킨다.<ref name=pmid10527663>{{저널 인용| vauthors = Erlandsen H, Stevens RC | title = The structural basis of phenylketonuria | journal = Molecular Genetics and Metabolism | volume = 68 | issue = 2 | pages = 103–25 | date = October 1999 | pmid = 10527663 | doi = 10.1006/mgme.1999.2922 }}</ref><ref>{{저널 인용| vauthors = Flatmark T, Stevens RC | title = Structural Insight into the Aromatic Amino Acid Hydroxylases and Their Disease-Related Mutant Forms | journal = Chemical Reviews | volume = 99 | issue = 8 | pages = 2137–2160 | date = August 1999 | pmid = 11849022 | doi = 10.1021/cr980450y }}</ref> 이러한 질환을 적절하게 치료하지 못하면 [[지적 장애]]를 유발할 수도 있다.<ref>{{서적 인용| title = Genes and Disease [Internet] | chapterurl = https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK22253/ | chapter = Phenylketonuria | publisher = National Center for Biotechnology Information (US) | location = Bethesda (MD) | year = 1998–2015 }}</ref> 또 다른 예로는 체내의 콜린 에스터 약물을 분해하는 능력이 저하되는 [[슈도콜린에스터레이스 결핍증]]이 있다.<ref>{{웹 인용| title = Pseudocholinesterase deficiency | url = http://ghr.nlm.nih.gov/condition/pseudocholinesterase-deficiency | publisher = U.S. National Library of Medicine | accessdate = 5 September 2013 }}</ref> 효소의 경구 투여는 [[외분비 이자기능부전]]<ref>{{저널 인용| vauthors = Fieker A, Philpott J, Armand M | title = Enzyme replacement therapy for pancreatic insufficiency: present and future | journal = Clinical and Experimental Gastroenterology | volume = 4 | pages = 55–73 | date = 2011 | pmid = 21753892 | pmc = 3132852 | doi = 10.2147/CEG.S17634 }}</ref> 및 [[젖당불내증]]<ref>{{저널 인용| vauthors = Misselwitz B, Pohl D, Frühauf H, Fried M, Vavricka SR, Fox M | title = Lactose malabsorption and intolerance: pathogenesis, diagnosis and treatment | journal = United European Gastroenterology Journal | volume = 1 | issue = 3 | pages = 151–9 | date = June 2013 | pmid = 24917953 | pmc = 4040760 | doi = 10.1177/2050640613484463 }}</ref>과 같은 일부 기능적 효소 결핍증을 치료할 수 있다.

효소의 이상이 질병을 일으킬 수 있는 또 다른 방법은 [[DNA 복구]] 효소들을 암호화하는 유전자에서 [[생식세포 돌연변이]]가 일어나는 것이다. 이러한 효소들의 결함은 세포가 [[게놈]]에서 일어나는 돌연변이들을 제대로 복구할 수 없기 때문에 돌연변이가 천천히 축적되어 암을 발생시킬 수도 있다. 이러한 유전성 암의 예로는 [[자외선]]에 대한 최소한의 노출에도 반응하여 [[피부암]]을 유발할 수 있는 [[색소성 건피증]]이 있다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Cleaver JE | title = Defective repair replication of DNA in xeroderma pigmentosum | journal = Nature | volume = 218 | issue = 5142 | pages = 652–6 | date = May 1968 | pmid = 5655953 | doi = 10.1038/218652a0 | bibcode = 1968Natur.218..652C }}</ref><ref name="Andrews">{{서적 인용| last1 = James | first1 = William D | last2 = Elston | first2 = Dirk | last3 = Berger | first3 = Timothy G | name-list-format = vanc | title = Andrews' Diseases of the Skin: Clinical Dermatology | date = 2011 | publisher = Saunders/ Elsevier | location = London | isbn = 978-1437703146 | edition = 11th | page = 567 }}</ref>

== 산업적 이용 ==
{{본문|산업용 효소}}효소는 매우 특정한 촉매가 필요할 때 [[화학공업]] 및 기타 산업 분야에서 사용된다. 효소는 일반적으로 유기 용매 및 고온에서 안정성이 떨어지기 때문에 산업적으로 이용할 수 있는 반응의 수는 제한된다. 결과적으로 [[단백질공학]]은 연구가 활발한 영역이며, 합리적인 설계 또는 시험관 내에서의 진화를 통해 새로운 특성을 갖는 새로운 효소를 만들려는 시도를 포함한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Renugopalakrishnan V, Garduño-Juárez R, Narasimhan G, Verma CS, Wei X, Li P | title = Rational design of thermally stable proteins: relevance to bionanotechnology | journal = Journal of Nanoscience and Nanotechnology | volume = 5 | issue = 11 | pages = 1759–1767 | date = November 2005 | pmid = 16433409 | doi = 10.1166/jnn.2005.441 }}</ref><ref>{{저널 인용| vauthors = Hult K, Berglund P | title = Engineered enzymes for improved organic synthesis | journal = Current Opinion in Biotechnology | volume = 14 | issue = 4 | pages = 395–400 | date = August 2003 | pmid = 12943848 | doi = 10.1016/S0958-1669(03)00095-8 }}</ref> 이러한 노력들은 성공하기 시작했고, 몇몇 효소들은 이제 자연에서 일어나지 않는 반응들을 촉매하기 위해 처음부터 설계되었다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Jiang L, Althoff EA, Clemente FR, Doyle L, Röthlisberger D, Zanghellini A, Gallaher JL, Betker JL, Tanaka F, Barbas CF, Hilvert D, Houk KN, Stoddard BL, Baker D | title = De novo computational design of retro-aldol enzymes | journal = Science | volume = 319 | issue = 5868 | pages = 1387–91 | date = March 2008 | pmid = 18323453 | pmc = 3431203 | doi = 10.1126/science.1152692 | bibcode = 2008Sci...319.1387J }}</ref>

{| class="wikitable"
|- style="text-align:center;"
! style="width:24%; "|적용
! style="width:38%; "|사용된 효소
! style="width:38%; "|용도
|- valign="top"
| style="border-top:solid 3px #aaa;" rowspan="2"|'''[[바이오 연료|바이오 연료 산업]]'''
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[셀룰레이스]]
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[셀룰로스 에탄올]]을 생산하기 위해 셀룰로스를 발효될 수 있는 당으로 분해한다.<ref name="cheng">{{저널 인용| vauthors = Sun Y, Cheng J | title = Hydrolysis of lignocellulosic materials for ethanol production: a review | journal = Bioresource Technology | volume = 83 | issue = 1 | pages = 1–11 | date = May 2002 | pmid = 12058826 | doi = 10.1016/S0960-8524(01)00212-7 }}</ref>
|- valign="top"
|[[리그니네이스]]
| 바이오 연료의 생산을 위한 [[바이오매스]]의 전처리<ref name="cheng" />
|- valign="top"
| style="border-top:solid 3px #aaa;" rowspan="2"| '''[[세탁 세제]]'''
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[프로테이스]], [[아밀레이스]], [[라이페이스]]
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|세탁물 및 식기류에서 단백질, 녹말, 지방 또는 오일의 얼룩을 제거한다.<ref name="Kirk">{{저널 인용| vauthors = Kirk O, Borchert TV, Fuglsang CC | title = Industrial enzyme applications | journal = Current Opinion in Biotechnology | date = August 2002 | volume = 13 | issue = 4 | pages = 345–351 | doi = 10.1016/S0958-1669(02)00328-2| pmid = 12323357 }}</ref>
|- valign="top"
|[[β-만노시데이스]]
| 일반 식품첨가물인 [[구아검]]에서 식품 얼룩을 제거한다.<ref name="Kirk" />
|- valign="top"
| style="border-top:solid 3px #aaa;" rowspan="4"| '''[[양조|양조 산업]]'''
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[아밀레이스]], [[글루카네이스]], [[프로테이스]]
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[맥아]]에서 다당류와 단백질을 분해한다.<ref name="briggs">{{서적 인용| last1 = Briggs | first1 = Dennis E. | title = Malts and Malting | url = https://archive.org/details/maltsmalting0000brig | date = 1998 | publisher = Blackie Academic | location = London | isbn = 978-0412298004 | edition = 1st | name-list-format = vanc }}</ref>
|- valign="top"
|[[글루카네이스|β-글루카네이스]]
|[[맥아즙]]과 맥주의 여과 특성을 향상시킨다.<ref name="briggs" />
|- valign="top"
|[[아밀레이스]], [[플루라네이스]]
| 저칼로리 [[맥주]]를 만들고 발효를 조절한다.<ref name="briggs" />
|- valign="top"
| 아세토락트산 탈카복실화효소
|[[다이아세틸]]의 생성을 줄임으로써 발효의 효율을 증가시킨다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Dulieu C, Moll M, Boudrant J, Poncelet D | title = Improved performances and control of beer fermentation using encapsulated alpha-acetolactate decarboxylase and modeling | journal = Biotechnology Progress | volume = 16 | issue = 6 | pages = 958–65 | pmid = 11101321 | doi = 10.1021/bp000128k | year=2000}}</ref>
|- valign="top"
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|'''[[조리 (음식)|조리에 사용]]'''
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[파파인]]
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|요리를 위해 고기를 부드럽게 만든다.<ref>{{서적 인용| first1 = Rodrigo | last1 =Tarté | title = Ingredients in Meat Products Properties, Functionality and Applications | date = 2008 | publisher = Springer | location = New York | isbn = 978-0-387-71327-4 | pages = 177| name-list-format = vanc }}</ref>
|- valign="top"
| style="border-top:solid 3px #aaa;" rowspan="2"| '''[[낙농|낙농 산업]]'''
| style = "border-top:solid 3px #aaa;"|[[키모신]] (레닌)
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[치즈]]의 제조 과정에서 단백질을 [[가수분해]]한다.<ref>{{웹 인용|url=http://www.gmo-compass.org/eng/database/enzymes/83.chymosin.html|accessdate=1 March 2015|date=10 July 2010|title=Chymosin – GMO Database|work=GMO Compass|publisher=European Union|url-status=dead|archiveurl=https://web.archive.org/web/20150326181805/http://www.gmo-compass.org/eng/database/enzymes/83.chymosin.html|archivedate=26 March 2015|df=dmy-all}}</ref>
|- valign="top"
|[[라이페이스]]
|[[로크포르]]와 같은 [[카망베르 (치즈)|카망베르 치즈]] 및 [[블루 치즈]]를 생산한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Molimard P, Spinnler HE | title = Review: Compounds Involved in the Flavor of Surface Mold-Ripened Cheeses: Origins and Properties | journal = Journal of Dairy Science | date = February 1996 | volume = 79 | issue = 2 | pages = 169–184 | doi = 10.3168/jds.S0022-0302(96)76348-8}}</ref>
|- valign="top"
| style="border-top:solid 3px #aaa;" rowspan="4"| '''[[식품 가공]]'''
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[아밀레이스]]
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[고과당 옥수수 시럽]]을 만드는 것과 같이 [[녹말]]로부터 당을 만드는데 사용한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Guzmán-Maldonado H, Paredes-López O | title = Amylolytic enzymes and products derived from starch: a review | journal = Critical Reviews in Food Science and Nutrition | volume = 35 | issue = 5 | pages = 373–403 | date = September 1995 | pmid = 8573280 | doi = 10.1080/10408399509527706 }}</ref>
|- valign="top"
|[[프로테이스]]
|[[비스킷]] 제조에서 [[밀가루]]의 단백질 수치를 낮춘다.<ref name="GMOdatabase" />
|- valign="top"
||[[트립신]]
|저자극성 이유식을 제조하는데 사용한다.<ref name="GMOdatabase">{{웹 인용| url = http://www.gmo-compass.org/eng/database/enzymes/94.protease.html | title = Protease – GMO Database | date = 10 July 2010 | work = GMO Compass | publisher = European Union | accessdate = 28 February 2015 | url-status = dead | archiveurl = https://web.archive.org/web/20150224164346/http://www.gmo-compass.org/eng/database/enzymes/94.protease.html | archivedate = 24 February 2015 | df = dmy-all }}</ref>
|- valign="top"
|[[셀룰레이스]], [[펙티네이스]]
|[[과일 주스]]를 투명해지게 하는데 사용한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Alkorta I, Garbisu C, Llama MJ, Serra JL | title = Industrial applications of pectic enzymes: a review | url = https://archive.org/details/sim_process-biochemistry_1998-01_33_1/page/n25 | journal = Process Biochemistry | date = January 1998 | volume = 33 | issue = 1 | pages = 21–28 | doi = 10.1016/S0032-9592(97)00046-0 }}</ref>
|- valign="top"
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|'''[[분자생물학]]'''
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[뉴클레이스]], [[DNA 연결효소]] 및 [[중합효소]]
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[재조합 DNA]]를 만들기 위해 [[제한효소]]와 [[중합효소 연쇄 반응]]을 이용한다.<ref name="Stryer_2002" />
|- valign="top"
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|'''[[종이|제지 산업]]'''
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[자일라네이스]], [[셀룰레이스|헤미셀룰레이스]], [[리그닌 과산화효소]]
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|크라프트 펄프에서 [[리그닌]]을 제거한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Bajpai P | title = Application of enzymes in the pulp and paper industry | journal = Biotechnology Progress | volume = 15 | issue = 2 | pages = 147–157 | date = March 1999 | pmid = 10194388 | doi = 10.1021/bp990013k }}</ref>
|- valign="top"
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|'''퍼스널 케어'''
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[프로테이스]]
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[콘택트 렌즈]]의 단백질을 제거하여 감염을 예방한다.<ref>{{저널 인용| vauthors = Begley CG, Paragina S, Sporn A | title = An analysis of contact lens enzyme cleaners | journal = Journal of the American Optometric Association | volume = 61 | issue = 3 | pages = 190–4 | date = March 1990 | pmid = 2186082 }}</ref>
|- valign="top"
| style="border-top:solid 3px #aaa;" rowspan="1"| '''[[녹말|녹말 산업]]'''
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[아밀레이스]]
| style="border-top:solid 3px #aaa;"|[[녹말]]을 [[포도당]]과 다양한 시럽으로 전환한다.<ref>{{서적 인용| editor1-last = BeMiller | editor1-first = James N. | editor2-last = Whistler | editor2-first = Roy L. | title = Starch Chemistry and Technology | date = 2009 | publisher = Academic | location = London | isbn = 9780080926551 | edition= 3rd | name-list-format = vanc | last1 = Farris | first1 = Paul L. | chapter = Economic Growth and Organization of the U.S. Starch Industry }}</ref>
|}

== 같이 보기 ==
{{위키공용분류}}
* [[효소 저해제]]
* [[경쟁적 저해]] (competitive inhibition)
* [[무경쟁적 저해]] (non-competitive inhibition)
* [[반경쟁적 저해]] (uncompetitive inhibition)
* [[:en:List of enzymes|효소의 목록]] (영어)
* [[보조 인자]]
* [[산업용 효소]]
* 효소 데이터베이스
** [[BRENDA]]
** [[ExPASy]]
** [[IntEnz]]
** [[KEGG]]
** [[MetaCyc]]

== 각주 ==
{{각주}}

== 추가 문헌 ==
{{Col-begin}}
{{Col-1-of-2}}
'''일반'''
* {{서적 인용| first1 = Jeremy M | last1 = Berg | first2 = John L | last2 = Tymoczko | first3 = Lubert | last3 = Stryer | title = Biochemistry | date = 2002 | publisher = W. H. Freeman | location = New York, NY | isbn = 0-7167-3051-0 | edition = 5th | url = https://archive.org/details/biochemistrychap00jere | name-list-format = vanc | url-access = registration }}, A biochemistry textbook available free online through NCBI Bookshelf.{{Open access}}

'''어원 및 역사'''
* {{서적 인용 | title = New Beer in an Old Bottle: Eduard Buchner and the Growth of Biochemical Knowledge | url = http://bip.cnrs-mrs.fr/bip10/buchner.htm | editor-first = Athel | editor-last = Cornish-Bowden | publisher = Universitat de València | year = 1997 | isbn = 84-370-3328-4 | name-list-format = vanc | access-date = 2019-09-19 | archive-date = 2010-12-13 | archive-url = https://web.archive.org/web/20101213084345/http://bip.cnrs-mrs.fr/bip10/buchner.htm | url-status = dead }}, A history of early enzymology.

{{Col-2-of-2}}

'''효소의 구조 및 메커니즘'''
* {{서적 인용| author = Suzuki H | title = How Enzymes Work: From Structure to Function | publisher = CRC Press | location = Boca Raton, FL | year = 2015 | isbn = 978-981-4463-92-8 }}

'''효소 반응속도론 및 저해'''
* {{서적 인용| last1 = Cornish-Bowden | first1 = Athel | title = Fundamentals of Enzyme Kinetics | date = 2012 | publisher = Wiley-VCH | location = Weinheim | isbn = 978-3527330744 | edition = 4th | name-list-format=vanc }}

{{Col-end}}

{{효소}}
{{생물학}}
{{식품화학}}
{{유기화학의 접사}}
{{전거 통제}}

[[분류:효소| ]]
[[분류:생화학]]
[[분류:생체분자]]
[[분류:촉매 반응]]
[[분류:물질대사]]
[[분류:공정 화학 물질]]